Protein–RNA interactions for Protein: Q2M3C7

SPHKAP, A-kinase anchor protein SPHKAP, humanhuman

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Length 1,700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHKAPQ2M3C7 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPHKAPQ2M3C7 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPHKAPQ2M3C7 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPHKAPQ2M3C7 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPHKAPQ2M3C7 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPHKAPQ2M3C7 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPHKAPQ2M3C7 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPHKAPQ2M3C7 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPHKAPQ2M3C7 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPHKAPQ2M3C7 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPHKAPQ2M3C7 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SPHKAPQ2M3C7 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPHKAPQ2M3C7 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPHKAPQ2M3C7 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SPHKAPQ2M3C7 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPHKAPQ2M3C7 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SPHKAPQ2M3C7 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPHKAPQ2M3C7 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPHKAPQ2M3C7 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPHKAPQ2M3C7 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPHKAPQ2M3C7 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPHKAPQ2M3C7 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPHKAPQ2M3C7 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPHKAPQ2M3C7 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPHKAPQ2M3C7 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPHKAPQ2M3C7 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPHKAPQ2M3C7 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPHKAPQ2M3C7 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SPHKAPQ2M3C7 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPHKAPQ2M3C7 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPHKAPQ2M3C7 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SPHKAPQ2M3C7 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPHKAPQ2M3C7 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPHKAPQ2M3C7 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPHKAPQ2M3C7 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPHKAPQ2M3C7 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPHKAPQ2M3C7 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPHKAPQ2M3C7 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SPHKAPQ2M3C7 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
SPHKAPQ2M3C7 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SPHKAPQ2M3C7 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SPHKAPQ2M3C7 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SPHKAPQ2M3C7 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SPHKAPQ2M3C7 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SPHKAPQ2M3C7 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SPHKAPQ2M3C7 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SPHKAPQ2M3C7 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SPHKAPQ2M3C7 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SPHKAPQ2M3C7 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SPHKAPQ2M3C7 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SPHKAPQ2M3C7 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SPHKAPQ2M3C7 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPHKAPQ2M3C7 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPHKAPQ2M3C7 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPHKAPQ2M3C7 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPHKAPQ2M3C7 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPHKAPQ2M3C7 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPHKAPQ2M3C7 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPHKAPQ2M3C7 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPHKAPQ2M3C7 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPHKAPQ2M3C7 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SPHKAPQ2M3C7 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPHKAPQ2M3C7 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPHKAPQ2M3C7 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPHKAPQ2M3C7 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPHKAPQ2M3C7 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPHKAPQ2M3C7 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPHKAPQ2M3C7 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPHKAPQ2M3C7 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPHKAPQ2M3C7 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPHKAPQ2M3C7 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPHKAPQ2M3C7 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPHKAPQ2M3C7 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPHKAPQ2M3C7 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPHKAPQ2M3C7 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPHKAPQ2M3C7 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPHKAPQ2M3C7 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SPHKAPQ2M3C7 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPHKAPQ2M3C7 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPHKAPQ2M3C7 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPHKAPQ2M3C7 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPHKAPQ2M3C7 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPHKAPQ2M3C7 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPHKAPQ2M3C7 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPHKAPQ2M3C7 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPHKAPQ2M3C7 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPHKAPQ2M3C7 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPHKAPQ2M3C7 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SPHKAPQ2M3C7 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPHKAPQ2M3C7 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPHKAPQ2M3C7 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPHKAPQ2M3C7 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPHKAPQ2M3C7 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPHKAPQ2M3C7 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPHKAPQ2M3C7 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SPHKAPQ2M3C7 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPHKAPQ2M3C7 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SPHKAPQ2M3C7 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPHKAPQ2M3C7 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPHKAPQ2M3C7 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
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