Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GEN1Q17RS7 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GEN1Q17RS7 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GEN1Q17RS7 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GEN1Q17RS7 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GEN1Q17RS7 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GEN1Q17RS7 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GEN1Q17RS7 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GEN1Q17RS7 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GEN1Q17RS7 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GEN1Q17RS7 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GEN1Q17RS7 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GEN1Q17RS7 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GEN1Q17RS7 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
GEN1Q17RS7 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
GEN1Q17RS7 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GEN1Q17RS7 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GEN1Q17RS7 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GEN1Q17RS7 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GEN1Q17RS7 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GEN1Q17RS7 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GEN1Q17RS7 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
GEN1Q17RS7 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GEN1Q17RS7 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
GEN1Q17RS7 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GEN1Q17RS7 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
GEN1Q17RS7 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GEN1Q17RS7 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GEN1Q17RS7 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GEN1Q17RS7 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GEN1Q17RS7 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GEN1Q17RS7 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GEN1Q17RS7 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GEN1Q17RS7 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GEN1Q17RS7 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GEN1Q17RS7 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GEN1Q17RS7 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GEN1Q17RS7 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GEN1Q17RS7 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GEN1Q17RS7 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GEN1Q17RS7 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GEN1Q17RS7 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GEN1Q17RS7 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GEN1Q17RS7 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GEN1Q17RS7 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GEN1Q17RS7 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GEN1Q17RS7 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GEN1Q17RS7 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GEN1Q17RS7 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GEN1Q17RS7 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GEN1Q17RS7 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GEN1Q17RS7 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GEN1Q17RS7 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GEN1Q17RS7 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GEN1Q17RS7 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GEN1Q17RS7 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GEN1Q17RS7 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GEN1Q17RS7 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GEN1Q17RS7 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GEN1Q17RS7 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GEN1Q17RS7 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GEN1Q17RS7 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GEN1Q17RS7 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GEN1Q17RS7 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GEN1Q17RS7 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GEN1Q17RS7 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GEN1Q17RS7 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GEN1Q17RS7 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GEN1Q17RS7 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GEN1Q17RS7 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GEN1Q17RS7 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GEN1Q17RS7 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
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GEN1Q17RS7 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GEN1Q17RS7 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GEN1Q17RS7 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GEN1Q17RS7 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GEN1Q17RS7 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GEN1Q17RS7 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GEN1Q17RS7 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GEN1Q17RS7 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GEN1Q17RS7 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GEN1Q17RS7 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GEN1Q17RS7 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GEN1Q17RS7 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GEN1Q17RS7 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GEN1Q17RS7 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GEN1Q17RS7 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GEN1Q17RS7 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GEN1Q17RS7 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GEN1Q17RS7 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GEN1Q17RS7 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GEN1Q17RS7 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GEN1Q17RS7 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GEN1Q17RS7 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GEN1Q17RS7 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GEN1Q17RS7 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GEN1Q17RS7 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GEN1Q17RS7 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GEN1Q17RS7 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
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