Protein–RNA interactions for Protein: Q16401

PSMD5, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 5, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD5Q16401 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMD5Q16401 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMD5Q16401 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMD5Q16401 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMD5Q16401 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMD5Q16401 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMD5Q16401 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMD5Q16401 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMD5Q16401 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMD5Q16401 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMD5Q16401 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMD5Q16401 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMD5Q16401 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMD5Q16401 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMD5Q16401 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMD5Q16401 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMD5Q16401 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMD5Q16401 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMD5Q16401 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMD5Q16401 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMD5Q16401 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMD5Q16401 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMD5Q16401 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMD5Q16401 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMD5Q16401 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMD5Q16401 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMD5Q16401 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMD5Q16401 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMD5Q16401 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMD5Q16401 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMD5Q16401 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMD5Q16401 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMD5Q16401 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMD5Q16401 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMD5Q16401 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMD5Q16401 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMD5Q16401 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMD5Q16401 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMD5Q16401 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMD5Q16401 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMD5Q16401 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMD5Q16401 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMD5Q16401 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMD5Q16401 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMD5Q16401 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMD5Q16401 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMD5Q16401 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMD5Q16401 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMD5Q16401 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMD5Q16401 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMD5Q16401 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMD5Q16401 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMD5Q16401 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMD5Q16401 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMD5Q16401 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMD5Q16401 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMD5Q16401 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMD5Q16401 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMD5Q16401 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMD5Q16401 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMD5Q16401 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMD5Q16401 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMD5Q16401 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMD5Q16401 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMD5Q16401 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMD5Q16401 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMD5Q16401 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMD5Q16401 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMD5Q16401 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMD5Q16401 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMD5Q16401 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMD5Q16401 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMD5Q16401 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMD5Q16401 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMD5Q16401 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMD5Q16401 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMD5Q16401 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMD5Q16401 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMD5Q16401 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMD5Q16401 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMD5Q16401 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMD5Q16401 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMD5Q16401 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMD5Q16401 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMD5Q16401 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMD5Q16401 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMD5Q16401 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMD5Q16401 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMD5Q16401 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMD5Q16401 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMD5Q16401 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PSMD5Q16401 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSMD5Q16401 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSMD5Q16401 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSMD5Q16401 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSMD5Q16401 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSMD5Q16401 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSMD5Q16401 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSMD5Q16401 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSMD5Q16401 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
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