Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

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Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NCOA1Q15788 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NCOA1Q15788 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
NCOA1Q15788 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NCOA1Q15788 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NCOA1Q15788 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NCOA1Q15788 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NCOA1Q15788 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NCOA1Q15788 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NCOA1Q15788 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NCOA1Q15788 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NCOA1Q15788 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NCOA1Q15788 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NCOA1Q15788 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NCOA1Q15788 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NCOA1Q15788 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NCOA1Q15788 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NCOA1Q15788 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NCOA1Q15788 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NCOA1Q15788 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NCOA1Q15788 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NCOA1Q15788 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NCOA1Q15788 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NCOA1Q15788 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NCOA1Q15788 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NCOA1Q15788 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NCOA1Q15788 AL355334.1-201ENST00000417713 215 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
NCOA1Q15788 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NCOA1Q15788 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NCOA1Q15788 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NCOA1Q15788 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
NCOA1Q15788 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NCOA1Q15788 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
NCOA1Q15788 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NCOA1Q15788 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NCOA1Q15788 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NCOA1Q15788 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NCOA1Q15788 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NCOA1Q15788 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NCOA1Q15788 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NCOA1Q15788 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NCOA1Q15788 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NCOA1Q15788 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NCOA1Q15788 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NCOA1Q15788 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NCOA1Q15788 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NCOA1Q15788 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NCOA1Q15788 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NCOA1Q15788 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NCOA1Q15788 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NCOA1Q15788 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NCOA1Q15788 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NCOA1Q15788 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NCOA1Q15788 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NCOA1Q15788 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
NCOA1Q15788 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
NCOA1Q15788 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
NCOA1Q15788 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NCOA1Q15788 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NCOA1Q15788 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NCOA1Q15788 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NCOA1Q15788 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NCOA1Q15788 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NCOA1Q15788 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NCOA1Q15788 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NCOA1Q15788 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NCOA1Q15788 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NCOA1Q15788 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NCOA1Q15788 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NCOA1Q15788 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
NCOA1Q15788 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NCOA1Q15788 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NCOA1Q15788 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NCOA1Q15788 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NCOA1Q15788 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NCOA1Q15788 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NCOA1Q15788 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NCOA1Q15788 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
NCOA1Q15788 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NCOA1Q15788 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NCOA1Q15788 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NCOA1Q15788 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NCOA1Q15788 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NCOA1Q15788 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NCOA1Q15788 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NCOA1Q15788 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NCOA1Q15788 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NCOA1Q15788 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NCOA1Q15788 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NCOA1Q15788 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
NCOA1Q15788 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
NCOA1Q15788 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
NCOA1Q15788 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
NCOA1Q15788 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
NCOA1Q15788 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NCOA1Q15788 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NCOA1Q15788 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NCOA1Q15788 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NCOA1Q15788 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NCOA1Q15788 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
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