Protein–RNA interactions for Protein: Q15075

EEA1, Early endosome antigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEA1Q15075 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
EEA1Q15075 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
EEA1Q15075 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
EEA1Q15075 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
EEA1Q15075 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
EEA1Q15075 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
EEA1Q15075 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
EEA1Q15075 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
EEA1Q15075 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
EEA1Q15075 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
EEA1Q15075 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
EEA1Q15075 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
EEA1Q15075 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
EEA1Q15075 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
EEA1Q15075 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
EEA1Q15075 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
EEA1Q15075 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
EEA1Q15075 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
EEA1Q15075 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
EEA1Q15075 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
EEA1Q15075 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
EEA1Q15075 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
EEA1Q15075 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
EEA1Q15075 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
EEA1Q15075 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
EEA1Q15075 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
EEA1Q15075 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
EEA1Q15075 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
EEA1Q15075 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
EEA1Q15075 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
EEA1Q15075 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EEA1Q15075 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EEA1Q15075 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
EEA1Q15075 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EEA1Q15075 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EEA1Q15075 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
EEA1Q15075 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EEA1Q15075 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EEA1Q15075 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
EEA1Q15075 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
EEA1Q15075 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
EEA1Q15075 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
EEA1Q15075 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
EEA1Q15075 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
EEA1Q15075 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
EEA1Q15075 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
EEA1Q15075 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
EEA1Q15075 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
EEA1Q15075 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
EEA1Q15075 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
EEA1Q15075 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
EEA1Q15075 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EEA1Q15075 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
EEA1Q15075 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
EEA1Q15075 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
EEA1Q15075 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
EEA1Q15075 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
EEA1Q15075 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
EEA1Q15075 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
EEA1Q15075 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
EEA1Q15075 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
EEA1Q15075 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
EEA1Q15075 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
EEA1Q15075 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
EEA1Q15075 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
EEA1Q15075 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
EEA1Q15075 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
EEA1Q15075 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
EEA1Q15075 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
EEA1Q15075 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
EEA1Q15075 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
EEA1Q15075 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
EEA1Q15075 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
EEA1Q15075 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
EEA1Q15075 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
EEA1Q15075 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
EEA1Q15075 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
EEA1Q15075 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
EEA1Q15075 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
EEA1Q15075 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
EEA1Q15075 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
EEA1Q15075 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
EEA1Q15075 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
EEA1Q15075 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
EEA1Q15075 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
EEA1Q15075 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
EEA1Q15075 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
EEA1Q15075 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
EEA1Q15075 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
EEA1Q15075 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
EEA1Q15075 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
EEA1Q15075 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
EEA1Q15075 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
EEA1Q15075 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
EEA1Q15075 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
EEA1Q15075 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
EEA1Q15075 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
EEA1Q15075 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
EEA1Q15075 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
EEA1Q15075 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
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