Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
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