Protein–RNA interactions for Protein: Q14790

CASP8, Caspase-8, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP8Q14790 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP8Q14790 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP8Q14790 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP8Q14790 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP8Q14790 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP8Q14790 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP8Q14790 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP8Q14790 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP8Q14790 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP8Q14790 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP8Q14790 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP8Q14790 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP8Q14790 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP8Q14790 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP8Q14790 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP8Q14790 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP8Q14790 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP8Q14790 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP8Q14790 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP8Q14790 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP8Q14790 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP8Q14790 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP8Q14790 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP8Q14790 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP8Q14790 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP8Q14790 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP8Q14790 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP8Q14790 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP8Q14790 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP8Q14790 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP8Q14790 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP8Q14790 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP8Q14790 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASP8Q14790 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASP8Q14790 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASP8Q14790 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASP8Q14790 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASP8Q14790 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASP8Q14790 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASP8Q14790 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASP8Q14790 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASP8Q14790 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASP8Q14790 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASP8Q14790 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASP8Q14790 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASP8Q14790 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASP8Q14790 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASP8Q14790 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASP8Q14790 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASP8Q14790 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASP8Q14790 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASP8Q14790 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASP8Q14790 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
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CASP8Q14790 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CASP8Q14790 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASP8Q14790 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASP8Q14790 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CASP8Q14790 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CASP8Q14790 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASP8Q14790 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASP8Q14790 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASP8Q14790 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
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CASP8Q14790 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASP8Q14790 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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CASP8Q14790 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
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CASP8Q14790 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASP8Q14790 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASP8Q14790 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASP8Q14790 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASP8Q14790 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASP8Q14790 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASP8Q14790 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASP8Q14790 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASP8Q14790 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CASP8Q14790 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASP8Q14790 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASP8Q14790 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASP8Q14790 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASP8Q14790 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASP8Q14790 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASP8Q14790 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASP8Q14790 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASP8Q14790 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASP8Q14790 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASP8Q14790 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASP8Q14790 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASP8Q14790 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASP8Q14790 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASP8Q14790 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CASP8Q14790 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASP8Q14790 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
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