Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNGB1Q14028 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNGB1Q14028 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNGB1Q14028 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNGB1Q14028 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNGB1Q14028 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNGB1Q14028 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNGB1Q14028 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
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CNGB1Q14028 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNGB1Q14028 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNGB1Q14028 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNGB1Q14028 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNGB1Q14028 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNGB1Q14028 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNGB1Q14028 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNGB1Q14028 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNGB1Q14028 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNGB1Q14028 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNGB1Q14028 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNGB1Q14028 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNGB1Q14028 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNGB1Q14028 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNGB1Q14028 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNGB1Q14028 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNGB1Q14028 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNGB1Q14028 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
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CNGB1Q14028 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNGB1Q14028 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNGB1Q14028 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNGB1Q14028 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CNGB1Q14028 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNGB1Q14028 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNGB1Q14028 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
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CNGB1Q14028 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNGB1Q14028 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNGB1Q14028 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
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CNGB1Q14028 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
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CNGB1Q14028 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
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CNGB1Q14028 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CNGB1Q14028 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
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CNGB1Q14028 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CNGB1Q14028 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CNGB1Q14028 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CNGB1Q14028 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CNGB1Q14028 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CNGB1Q14028 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CNGB1Q14028 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CNGB1Q14028 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CNGB1Q14028 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CNGB1Q14028 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CNGB1Q14028 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CNGB1Q14028 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CNGB1Q14028 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CNGB1Q14028 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CNGB1Q14028 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CNGB1Q14028 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CNGB1Q14028 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CNGB1Q14028 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CNGB1Q14028 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CNGB1Q14028 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CNGB1Q14028 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CNGB1Q14028 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CNGB1Q14028 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CNGB1Q14028 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
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