Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DDX39BQ13838 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DDX39BQ13838 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DDX39BQ13838 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DDX39BQ13838 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DDX39BQ13838 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DDX39BQ13838 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DDX39BQ13838 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DDX39BQ13838 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DDX39BQ13838 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DDX39BQ13838 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DDX39BQ13838 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DDX39BQ13838 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DDX39BQ13838 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DDX39BQ13838 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
DDX39BQ13838 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DDX39BQ13838 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DDX39BQ13838 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DDX39BQ13838 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DDX39BQ13838 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DDX39BQ13838 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DDX39BQ13838 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DDX39BQ13838 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DDX39BQ13838 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
DDX39BQ13838 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DDX39BQ13838 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DDX39BQ13838 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DDX39BQ13838 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DDX39BQ13838 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
DDX39BQ13838 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
DDX39BQ13838 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DDX39BQ13838 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DDX39BQ13838 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DDX39BQ13838 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DDX39BQ13838 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DDX39BQ13838 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DDX39BQ13838 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DDX39BQ13838 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DDX39BQ13838 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DDX39BQ13838 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DDX39BQ13838 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DDX39BQ13838 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DDX39BQ13838 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DDX39BQ13838 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DDX39BQ13838 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DDX39BQ13838 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DDX39BQ13838 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
DDX39BQ13838 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DDX39BQ13838 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DDX39BQ13838 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DDX39BQ13838 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DDX39BQ13838 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DDX39BQ13838 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DDX39BQ13838 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
DDX39BQ13838 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DDX39BQ13838 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DDX39BQ13838 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DDX39BQ13838 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DDX39BQ13838 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DDX39BQ13838 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DDX39BQ13838 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DDX39BQ13838 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DDX39BQ13838 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DDX39BQ13838 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DDX39BQ13838 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
DDX39BQ13838 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
DDX39BQ13838 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DDX39BQ13838 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
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DDX39BQ13838 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DDX39BQ13838 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DDX39BQ13838 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DDX39BQ13838 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
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DDX39BQ13838 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DDX39BQ13838 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DDX39BQ13838 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
DDX39BQ13838 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DDX39BQ13838 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DDX39BQ13838 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DDX39BQ13838 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DDX39BQ13838 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DDX39BQ13838 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DDX39BQ13838 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DDX39BQ13838 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DDX39BQ13838 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DDX39BQ13838 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DDX39BQ13838 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DDX39BQ13838 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DDX39BQ13838 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DDX39BQ13838 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DDX39BQ13838 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DDX39BQ13838 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DDX39BQ13838 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DDX39BQ13838 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DDX39BQ13838 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DDX39BQ13838 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
DDX39BQ13838 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
DDX39BQ13838 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
DDX39BQ13838 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
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