Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

Predictions only

Length 1,616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM2Q13796 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SHROOM2Q13796 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SHROOM2Q13796 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SHROOM2Q13796 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SHROOM2Q13796 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SHROOM2Q13796 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SHROOM2Q13796 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SHROOM2Q13796 CMTM5-201ENST00000339180 1173 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SHROOM2Q13796 CMTM5-202ENST00000342473 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SHROOM2Q13796 CMTM5-205ENST00000397227 818 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SHROOM2Q13796 NSD1-211ENST00000511258 809 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SHROOM2Q13796 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SHROOM2Q13796 CMTM5-208ENST00000555731 831 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SHROOM2Q13796 AC009119.2-201ENST00000561562 723 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SHROOM2Q13796 AC145207.8-201ENST00000580897 563 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SHROOM2Q13796 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SHROOM2Q13796 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SHROOM2Q13796 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SHROOM2Q13796 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SHROOM2Q13796 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SHROOM2Q13796 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SHROOM2Q13796 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SHROOM2Q13796 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SHROOM2Q13796 AL590093.1-201ENST00000416119 623 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SHROOM2Q13796 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SHROOM2Q13796 AC018463.1-201ENST00000456674 917 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SHROOM2Q13796 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SHROOM2Q13796 AL118516.1-201ENST00000564152 670 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SHROOM2Q13796 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SHROOM2Q13796 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SHROOM2Q13796 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SHROOM2Q13796 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SHROOM2Q13796 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SHROOM2Q13796 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SHROOM2Q13796 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SHROOM2Q13796 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SHROOM2Q13796 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SHROOM2Q13796 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SHROOM2Q13796 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SHROOM2Q13796 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SHROOM2Q13796 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SHROOM2Q13796 MIR22HG-201ENST00000334146 1383 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SHROOM2Q13796 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SHROOM2Q13796 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SHROOM2Q13796 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SHROOM2Q13796 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SHROOM2Q13796 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SHROOM2Q13796 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SHROOM2Q13796 IZUMO1R-202ENST00000440961 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SHROOM2Q13796 AC003982.2-201ENST00000536933 365 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SHROOM2Q13796 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SHROOM2Q13796 RN7SL596P-201ENST00000582123 288 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SHROOM2Q13796 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SHROOM2Q13796 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SHROOM2Q13796 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SHROOM2Q13796 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SHROOM2Q13796 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SHROOM2Q13796 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SHROOM2Q13796 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SHROOM2Q13796 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SHROOM2Q13796 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SHROOM2Q13796 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SHROOM2Q13796 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SHROOM2Q13796 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SHROOM2Q13796 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SHROOM2Q13796 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SHROOM2Q13796 MRPL49-209ENST00000534078 518 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SHROOM2Q13796 AC093567.1-201ENST00000590649 877 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SHROOM2Q13796 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SHROOM2Q13796 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SHROOM2Q13796 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
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SHROOM2Q13796 IFI35-203ENST00000415816 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SHROOM2Q13796 AC073094.1-201ENST00000453798 433 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SHROOM2Q13796 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SHROOM2Q13796 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SHROOM2Q13796 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SHROOM2Q13796 GLUD1P2-203ENST00000631118 486 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SHROOM2Q13796 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SHROOM2Q13796 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SHROOM2Q13796 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SHROOM2Q13796 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SHROOM2Q13796 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SHROOM2Q13796 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SHROOM2Q13796 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SHROOM2Q13796 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SHROOM2Q13796 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SHROOM2Q13796 LYPLA2P1-203ENST00000447689 696 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SHROOM2Q13796 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SHROOM2Q13796 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SHROOM2Q13796 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SHROOM2Q13796 SLC44A3-209ENST00000532427 1912 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SHROOM2Q13796 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SHROOM2Q13796 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SHROOM2Q13796 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SHROOM2Q13796 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
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