Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

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Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CACNA1SQ13698 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CACNA1SQ13698 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CACNA1SQ13698 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CACNA1SQ13698 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CACNA1SQ13698 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CACNA1SQ13698 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CACNA1SQ13698 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CACNA1SQ13698 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CACNA1SQ13698 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CACNA1SQ13698 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CACNA1SQ13698 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CACNA1SQ13698 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CACNA1SQ13698 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CACNA1SQ13698 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CACNA1SQ13698 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CACNA1SQ13698 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CACNA1SQ13698 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CACNA1SQ13698 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CACNA1SQ13698 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CACNA1SQ13698 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CACNA1SQ13698 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CACNA1SQ13698 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CACNA1SQ13698 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CACNA1SQ13698 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CACNA1SQ13698 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CACNA1SQ13698 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CACNA1SQ13698 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CACNA1SQ13698 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CACNA1SQ13698 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CACNA1SQ13698 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CACNA1SQ13698 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CACNA1SQ13698 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CACNA1SQ13698 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CACNA1SQ13698 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CACNA1SQ13698 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CACNA1SQ13698 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CACNA1SQ13698 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CACNA1SQ13698 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CACNA1SQ13698 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CACNA1SQ13698 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CACNA1SQ13698 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CACNA1SQ13698 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CACNA1SQ13698 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CACNA1SQ13698 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CACNA1SQ13698 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CACNA1SQ13698 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CACNA1SQ13698 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CACNA1SQ13698 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CACNA1SQ13698 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CACNA1SQ13698 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CACNA1SQ13698 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CACNA1SQ13698 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CACNA1SQ13698 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CACNA1SQ13698 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CACNA1SQ13698 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CACNA1SQ13698 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CACNA1SQ13698 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CACNA1SQ13698 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CACNA1SQ13698 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CACNA1SQ13698 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CACNA1SQ13698 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CACNA1SQ13698 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CACNA1SQ13698 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CACNA1SQ13698 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CACNA1SQ13698 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CACNA1SQ13698 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CACNA1SQ13698 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CACNA1SQ13698 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CACNA1SQ13698 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CACNA1SQ13698 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CACNA1SQ13698 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CACNA1SQ13698 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CACNA1SQ13698 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CACNA1SQ13698 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CACNA1SQ13698 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CACNA1SQ13698 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CACNA1SQ13698 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CACNA1SQ13698 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CACNA1SQ13698 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CACNA1SQ13698 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CACNA1SQ13698 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CACNA1SQ13698 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CACNA1SQ13698 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CACNA1SQ13698 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CACNA1SQ13698 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CACNA1SQ13698 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CACNA1SQ13698 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CACNA1SQ13698 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CACNA1SQ13698 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CACNA1SQ13698 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CACNA1SQ13698 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CACNA1SQ13698 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CACNA1SQ13698 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CACNA1SQ13698 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CACNA1SQ13698 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CACNA1SQ13698 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CACNA1SQ13698 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CACNA1SQ13698 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CACNA1SQ13698 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
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