Protein–RNA interactions for Protein: Q12988

HSPB3, Heat shock protein beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB3Q12988 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HSPB3Q12988 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
HSPB3Q12988 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HSPB3Q12988 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HSPB3Q12988 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HSPB3Q12988 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HSPB3Q12988 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HSPB3Q12988 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HSPB3Q12988 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HSPB3Q12988 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HSPB3Q12988 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HSPB3Q12988 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HSPB3Q12988 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HSPB3Q12988 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HSPB3Q12988 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HSPB3Q12988 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HSPB3Q12988 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HSPB3Q12988 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HSPB3Q12988 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HSPB3Q12988 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HSPB3Q12988 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HSPB3Q12988 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HSPB3Q12988 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HSPB3Q12988 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HSPB3Q12988 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HSPB3Q12988 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HSPB3Q12988 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HSPB3Q12988 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HSPB3Q12988 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HSPB3Q12988 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HSPB3Q12988 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HSPB3Q12988 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
HSPB3Q12988 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HSPB3Q12988 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HSPB3Q12988 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HSPB3Q12988 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HSPB3Q12988 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HSPB3Q12988 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HSPB3Q12988 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HSPB3Q12988 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
HSPB3Q12988 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HSPB3Q12988 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HSPB3Q12988 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HSPB3Q12988 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HSPB3Q12988 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HSPB3Q12988 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HSPB3Q12988 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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