Protein–RNA interactions for Protein: Q12907

LMAN2, Vesicular integral-membrane protein VIP36, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN2Q12907 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LMAN2Q12907 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LMAN2Q12907 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LMAN2Q12907 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LMAN2Q12907 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LMAN2Q12907 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LMAN2Q12907 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LMAN2Q12907 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
LMAN2Q12907 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LMAN2Q12907 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LMAN2Q12907 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LMAN2Q12907 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LMAN2Q12907 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LMAN2Q12907 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LMAN2Q12907 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LMAN2Q12907 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LMAN2Q12907 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
LMAN2Q12907 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LMAN2Q12907 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LMAN2Q12907 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LMAN2Q12907 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LMAN2Q12907 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LMAN2Q12907 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LMAN2Q12907 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LMAN2Q12907 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LMAN2Q12907 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LMAN2Q12907 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LMAN2Q12907 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LMAN2Q12907 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LMAN2Q12907 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LMAN2Q12907 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LMAN2Q12907 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LMAN2Q12907 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LMAN2Q12907 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LMAN2Q12907 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LMAN2Q12907 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LMAN2Q12907 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LMAN2Q12907 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LMAN2Q12907 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LMAN2Q12907 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LMAN2Q12907 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LMAN2Q12907 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LMAN2Q12907 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LMAN2Q12907 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LMAN2Q12907 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LMAN2Q12907 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LMAN2Q12907 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LMAN2Q12907 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LMAN2Q12907 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LMAN2Q12907 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LMAN2Q12907 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LMAN2Q12907 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LMAN2Q12907 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LMAN2Q12907 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LMAN2Q12907 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LMAN2Q12907 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LMAN2Q12907 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LMAN2Q12907 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LMAN2Q12907 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LMAN2Q12907 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LMAN2Q12907 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LMAN2Q12907 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LMAN2Q12907 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LMAN2Q12907 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LMAN2Q12907 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LMAN2Q12907 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LMAN2Q12907 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LMAN2Q12907 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LMAN2Q12907 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LMAN2Q12907 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LMAN2Q12907 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LMAN2Q12907 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LMAN2Q12907 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LMAN2Q12907 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LMAN2Q12907 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LMAN2Q12907 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LMAN2Q12907 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LMAN2Q12907 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LMAN2Q12907 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LMAN2Q12907 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LMAN2Q12907 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LMAN2Q12907 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LMAN2Q12907 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LMAN2Q12907 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
LMAN2Q12907 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
LMAN2Q12907 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LMAN2Q12907 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
LMAN2Q12907 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LMAN2Q12907 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LMAN2Q12907 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LMAN2Q12907 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LMAN2Q12907 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LMAN2Q12907 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LMAN2Q12907 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LMAN2Q12907 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LMAN2Q12907 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LMAN2Q12907 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LMAN2Q12907 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LMAN2Q12907 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LMAN2Q12907 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms