Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

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Length 1,464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GRIN2AQ12879 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
GRIN2AQ12879 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GRIN2AQ12879 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GRIN2AQ12879 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
GRIN2AQ12879 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GRIN2AQ12879 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GRIN2AQ12879 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GRIN2AQ12879 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GRIN2AQ12879 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GRIN2AQ12879 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
GRIN2AQ12879 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GRIN2AQ12879 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GRIN2AQ12879 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GRIN2AQ12879 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GRIN2AQ12879 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
GRIN2AQ12879 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GRIN2AQ12879 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GRIN2AQ12879 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GRIN2AQ12879 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GRIN2AQ12879 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
GRIN2AQ12879 LINC01481-204ENST00000550216 494 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GRIN2AQ12879 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GRIN2AQ12879 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
GRIN2AQ12879 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
GRIN2AQ12879 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
GRIN2AQ12879 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GRIN2AQ12879 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GRIN2AQ12879 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GRIN2AQ12879 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GRIN2AQ12879 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
GRIN2AQ12879 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
GRIN2AQ12879 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GRIN2AQ12879 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GRIN2AQ12879 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
GRIN2AQ12879 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GRIN2AQ12879 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GRIN2AQ12879 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
GRIN2AQ12879 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
GRIN2AQ12879 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GRIN2AQ12879 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GRIN2AQ12879 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GRIN2AQ12879 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GRIN2AQ12879 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GRIN2AQ12879 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GRIN2AQ12879 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GRIN2AQ12879 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GRIN2AQ12879 FOS-204ENST00000554617 796 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GRIN2AQ12879 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GRIN2AQ12879 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GRIN2AQ12879 AC141586.1-203ENST00000567242 366 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
GRIN2AQ12879 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GRIN2AQ12879 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GRIN2AQ12879 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GRIN2AQ12879 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
GRIN2AQ12879 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GRIN2AQ12879 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GRIN2AQ12879 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GRIN2AQ12879 AC025271.4-201ENST00000621477 1726 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
GRIN2AQ12879 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GRIN2AQ12879 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GRIN2AQ12879 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GRIN2AQ12879 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GRIN2AQ12879 CHCHD2-201ENST00000395422 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GRIN2AQ12879 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GRIN2AQ12879 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GRIN2AQ12879 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GRIN2AQ12879 MPZL3-203ENST00000525386 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GRIN2AQ12879 AC006435.2-201ENST00000574290 846 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GRIN2AQ12879 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GRIN2AQ12879 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GRIN2AQ12879 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GRIN2AQ12879 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GRIN2AQ12879 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GRIN2AQ12879 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GRIN2AQ12879 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
GRIN2AQ12879 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GRIN2AQ12879 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GRIN2AQ12879 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GRIN2AQ12879 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GRIN2AQ12879 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GRIN2AQ12879 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GRIN2AQ12879 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
GRIN2AQ12879 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GRIN2AQ12879 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GRIN2AQ12879 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
GRIN2AQ12879 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GRIN2AQ12879 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GRIN2AQ12879 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GRIN2AQ12879 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GRIN2AQ12879 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GRIN2AQ12879 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GRIN2AQ12879 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GRIN2AQ12879 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GRIN2AQ12879 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GRIN2AQ12879 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GRIN2AQ12879 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GRIN2AQ12879 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GRIN2AQ12879 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GRIN2AQ12879 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
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