Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNMA1Q12791 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNMA1Q12791 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNMA1Q12791 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNMA1Q12791 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCNMA1Q12791 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCNMA1Q12791 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCNMA1Q12791 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCNMA1Q12791 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCNMA1Q12791 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCNMA1Q12791 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCNMA1Q12791 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCNMA1Q12791 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCNMA1Q12791 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCNMA1Q12791 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCNMA1Q12791 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCNMA1Q12791 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCNMA1Q12791 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCNMA1Q12791 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCNMA1Q12791 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCNMA1Q12791 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCNMA1Q12791 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCNMA1Q12791 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCNMA1Q12791 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCNMA1Q12791 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCNMA1Q12791 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCNMA1Q12791 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCNMA1Q12791 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCNMA1Q12791 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
KCNMA1Q12791 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCNMA1Q12791 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
KCNMA1Q12791 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCNMA1Q12791 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCNMA1Q12791 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCNMA1Q12791 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCNMA1Q12791 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCNMA1Q12791 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCNMA1Q12791 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCNMA1Q12791 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCNMA1Q12791 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCNMA1Q12791 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCNMA1Q12791 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCNMA1Q12791 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
KCNMA1Q12791 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCNMA1Q12791 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCNMA1Q12791 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCNMA1Q12791 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCNMA1Q12791 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCNMA1Q12791 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCNMA1Q12791 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCNMA1Q12791 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCNMA1Q12791 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCNMA1Q12791 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCNMA1Q12791 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCNMA1Q12791 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCNMA1Q12791 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KCNMA1Q12791 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KCNMA1Q12791 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KCNMA1Q12791 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KCNMA1Q12791 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KCNMA1Q12791 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KCNMA1Q12791 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KCNMA1Q12791 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KCNMA1Q12791 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KCNMA1Q12791 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KCNMA1Q12791 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KCNMA1Q12791 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KCNMA1Q12791 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KCNMA1Q12791 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KCNMA1Q12791 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KCNMA1Q12791 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KCNMA1Q12791 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KCNMA1Q12791 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KCNMA1Q12791 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KCNMA1Q12791 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
KCNMA1Q12791 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KCNMA1Q12791 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KCNMA1Q12791 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
KCNMA1Q12791 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KCNMA1Q12791 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KCNMA1Q12791 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KCNMA1Q12791 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KCNMA1Q12791 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KCNMA1Q12791 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KCNMA1Q12791 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KCNMA1Q12791 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KCNMA1Q12791 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KCNMA1Q12791 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KCNMA1Q12791 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KCNMA1Q12791 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KCNMA1Q12791 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KCNMA1Q12791 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KCNMA1Q12791 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KCNMA1Q12791 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KCNMA1Q12791 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KCNMA1Q12791 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KCNMA1Q12791 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KCNMA1Q12791 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KCNMA1Q12791 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KCNMA1Q12791 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms