Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms