Protein–RNA interactions for Protein: Q07001

CHRND, Acetylcholine receptor subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNDQ07001 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CHRNDQ07001 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CHRNDQ07001 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
CHRNDQ07001 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
CHRNDQ07001 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CHRNDQ07001 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CHRNDQ07001 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CHRNDQ07001 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHRNDQ07001 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHRNDQ07001 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHRNDQ07001 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHRNDQ07001 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHRNDQ07001 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHRNDQ07001 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHRNDQ07001 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CHRNDQ07001 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CHRNDQ07001 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHRNDQ07001 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHRNDQ07001 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHRNDQ07001 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHRNDQ07001 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHRNDQ07001 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHRNDQ07001 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CHRNDQ07001 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHRNDQ07001 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHRNDQ07001 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHRNDQ07001 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHRNDQ07001 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHRNDQ07001 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHRNDQ07001 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHRNDQ07001 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHRNDQ07001 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHRNDQ07001 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHRNDQ07001 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHRNDQ07001 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHRNDQ07001 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHRNDQ07001 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHRNDQ07001 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHRNDQ07001 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHRNDQ07001 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHRNDQ07001 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHRNDQ07001 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHRNDQ07001 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHRNDQ07001 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CHRNDQ07001 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CHRNDQ07001 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CHRNDQ07001 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHRNDQ07001 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CHRNDQ07001 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHRNDQ07001 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHRNDQ07001 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHRNDQ07001 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHRNDQ07001 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CHRNDQ07001 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CHRNDQ07001 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CHRNDQ07001 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHRNDQ07001 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHRNDQ07001 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHRNDQ07001 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHRNDQ07001 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CHRNDQ07001 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHRNDQ07001 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHRNDQ07001 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHRNDQ07001 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHRNDQ07001 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHRNDQ07001 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHRNDQ07001 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHRNDQ07001 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHRNDQ07001 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHRNDQ07001 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHRNDQ07001 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHRNDQ07001 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHRNDQ07001 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHRNDQ07001 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHRNDQ07001 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHRNDQ07001 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHRNDQ07001 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHRNDQ07001 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHRNDQ07001 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHRNDQ07001 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHRNDQ07001 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHRNDQ07001 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHRNDQ07001 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHRNDQ07001 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHRNDQ07001 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHRNDQ07001 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CHRNDQ07001 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHRNDQ07001 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CHRNDQ07001 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHRNDQ07001 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHRNDQ07001 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHRNDQ07001 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHRNDQ07001 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHRNDQ07001 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHRNDQ07001 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHRNDQ07001 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHRNDQ07001 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHRNDQ07001 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHRNDQ07001 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHRNDQ07001 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms