Protein–RNA interactions for Protein: Q06323

PSME1, Proteasome activator complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME1Q06323 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PSME1Q06323 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PSME1Q06323 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PSME1Q06323 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PSME1Q06323 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
PSME1Q06323 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PSME1Q06323 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PSME1Q06323 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PSME1Q06323 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
PSME1Q06323 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PSME1Q06323 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PSME1Q06323 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PSME1Q06323 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PSME1Q06323 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PSME1Q06323 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PSME1Q06323 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PSME1Q06323 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PSME1Q06323 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PSME1Q06323 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
PSME1Q06323 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PSME1Q06323 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
PSME1Q06323 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PSME1Q06323 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
PSME1Q06323 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
PSME1Q06323 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PSME1Q06323 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
PSME1Q06323 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PSME1Q06323 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PSME1Q06323 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PSME1Q06323 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PSME1Q06323 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PSME1Q06323 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PSME1Q06323 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PSME1Q06323 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PSME1Q06323 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PSME1Q06323 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PSME1Q06323 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
PSME1Q06323 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PSME1Q06323 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PSME1Q06323 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PSME1Q06323 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PSME1Q06323 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PSME1Q06323 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PSME1Q06323 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PSME1Q06323 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PSME1Q06323 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PSME1Q06323 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PSME1Q06323 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PSME1Q06323 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PSME1Q06323 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PSME1Q06323 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PSME1Q06323 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PSME1Q06323 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PSME1Q06323 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PSME1Q06323 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PSME1Q06323 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PSME1Q06323 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
PSME1Q06323 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PSME1Q06323 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PSME1Q06323 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PSME1Q06323 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PSME1Q06323 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PSME1Q06323 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PSME1Q06323 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PSME1Q06323 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PSME1Q06323 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PSME1Q06323 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PSME1Q06323 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PSME1Q06323 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PSME1Q06323 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PSME1Q06323 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PSME1Q06323 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PSME1Q06323 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PSME1Q06323 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PSME1Q06323 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PSME1Q06323 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PSME1Q06323 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PSME1Q06323 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PSME1Q06323 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PSME1Q06323 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
PSME1Q06323 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
PSME1Q06323 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PSME1Q06323 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
PSME1Q06323 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PSME1Q06323 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
PSME1Q06323 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PSME1Q06323 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PSME1Q06323 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PSME1Q06323 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
PSME1Q06323 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PSME1Q06323 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PSME1Q06323 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PSME1Q06323 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PSME1Q06323 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PSME1Q06323 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PSME1Q06323 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PSME1Q06323 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PSME1Q06323 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PSME1Q06323 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PSME1Q06323 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms