Protein–RNA interactions for Protein: Q04656

ATP7A, Copper-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7AQ04656 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP7AQ04656 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP7AQ04656 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP7AQ04656 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP7AQ04656 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP7AQ04656 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP7AQ04656 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP7AQ04656 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP7AQ04656 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP7AQ04656 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP7AQ04656 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP7AQ04656 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP7AQ04656 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP7AQ04656 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP7AQ04656 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP7AQ04656 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP7AQ04656 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP7AQ04656 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP7AQ04656 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP7AQ04656 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP7AQ04656 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP7AQ04656 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP7AQ04656 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP7AQ04656 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP7AQ04656 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP7AQ04656 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP7AQ04656 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP7AQ04656 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP7AQ04656 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP7AQ04656 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP7AQ04656 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP7AQ04656 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP7AQ04656 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP7AQ04656 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP7AQ04656 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP7AQ04656 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP7AQ04656 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP7AQ04656 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ATP7AQ04656 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP7AQ04656 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP7AQ04656 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP7AQ04656 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP7AQ04656 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP7AQ04656 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP7AQ04656 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP7AQ04656 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP7AQ04656 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP7AQ04656 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP7AQ04656 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP7AQ04656 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP7AQ04656 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP7AQ04656 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP7AQ04656 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP7AQ04656 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP7AQ04656 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP7AQ04656 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP7AQ04656 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP7AQ04656 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP7AQ04656 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP7AQ04656 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP7AQ04656 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP7AQ04656 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP7AQ04656 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP7AQ04656 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP7AQ04656 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP7AQ04656 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP7AQ04656 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP7AQ04656 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP7AQ04656 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP7AQ04656 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP7AQ04656 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP7AQ04656 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP7AQ04656 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP7AQ04656 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP7AQ04656 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP7AQ04656 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP7AQ04656 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP7AQ04656 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP7AQ04656 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP7AQ04656 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP7AQ04656 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP7AQ04656 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP7AQ04656 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP7AQ04656 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP7AQ04656 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP7AQ04656 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP7AQ04656 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP7AQ04656 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP7AQ04656 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP7AQ04656 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP7AQ04656 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP7AQ04656 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP7AQ04656 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP7AQ04656 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP7AQ04656 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP7AQ04656 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP7AQ04656 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP7AQ04656 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP7AQ04656 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP7AQ04656 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms