Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 AC010234.1-201ENST00000494599 870 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 DNM1P51-201ENST00000558149 522 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 SGCA-201ENST00000262018 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 CTSL-202ENST00000342020 933 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 FAU-202ENST00000434372 533 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 SERBP1P2-201ENST00000436888 1164 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 AC012213.1-201ENST00000517376 722 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 TTPAL-203ENST00000372906 1139 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 ZNF879-202ENST00000519896 543 ntTSL 4 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 MIR5196-201ENST00000578146 115 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 AC138466.4-201ENST00000623965 852 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 SLC25A20-202ENST00000430379 1576 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 FXYD2-205ENST00000528014 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms