Protein–RNA interactions for Protein: Q00610

CLTC, Clathrin heavy chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCQ00610 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLTCQ00610 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLTCQ00610 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLTCQ00610 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CLTCQ00610 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLTCQ00610 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLTCQ00610 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLTCQ00610 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLTCQ00610 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLTCQ00610 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLTCQ00610 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLTCQ00610 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLTCQ00610 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLTCQ00610 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CLTCQ00610 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CLTCQ00610 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CLTCQ00610 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLTCQ00610 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLTCQ00610 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLTCQ00610 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLTCQ00610 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLTCQ00610 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLTCQ00610 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLTCQ00610 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLTCQ00610 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLTCQ00610 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLTCQ00610 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLTCQ00610 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CLTCQ00610 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CLTCQ00610 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLTCQ00610 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CLTCQ00610 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLTCQ00610 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CLTCQ00610 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLTCQ00610 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLTCQ00610 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLTCQ00610 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLTCQ00610 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLTCQ00610 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLTCQ00610 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLTCQ00610 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLTCQ00610 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLTCQ00610 AC234644.1-201ENST00000406065 370 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CLTCQ00610 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLTCQ00610 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLTCQ00610 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CLTCQ00610 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CLTCQ00610 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLTCQ00610 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CLTCQ00610 AC024361.2-201ENST00000574471 898 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLTCQ00610 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLTCQ00610 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLTCQ00610 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLTCQ00610 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLTCQ00610 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLTCQ00610 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLTCQ00610 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLTCQ00610 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLTCQ00610 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLTCQ00610 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLTCQ00610 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLTCQ00610 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLTCQ00610 C12orf76-207ENST00000549724 1302 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLTCQ00610 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLTCQ00610 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLTCQ00610 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLTCQ00610 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CLTCQ00610 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLTCQ00610 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLTCQ00610 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CLTCQ00610 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CLTCQ00610 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLTCQ00610 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLTCQ00610 ZNF528-AS1-202ENST00000596746 929 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLTCQ00610 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CLTCQ00610 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLTCQ00610 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLTCQ00610 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLTCQ00610 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLTCQ00610 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLTCQ00610 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLTCQ00610 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLTCQ00610 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLTCQ00610 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLTCQ00610 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLTCQ00610 CNR1-201ENST00000362094 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLTCQ00610 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLTCQ00610 VEGFB-202ENST00000426086 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLTCQ00610 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CLTCQ00610 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CLTCQ00610 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLTCQ00610 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CLTCQ00610 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CLTCQ00610 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLTCQ00610 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLTCQ00610 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLTCQ00610 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLTCQ00610 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLTCQ00610 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLTCQ00610 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms