Protein–RNA interactions for Protein: P61421

ATP6V0D1, V-type proton ATPase subunit d 1, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V0D1P61421 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP6V0D1P61421 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP6V0D1P61421 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP6V0D1P61421 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP6V0D1P61421 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP6V0D1P61421 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP6V0D1P61421 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP6V0D1P61421 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP6V0D1P61421 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP6V0D1P61421 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP6V0D1P61421 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP6V0D1P61421 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP6V0D1P61421 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP6V0D1P61421 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP6V0D1P61421 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP6V0D1P61421 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP6V0D1P61421 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP6V0D1P61421 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP6V0D1P61421 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP6V0D1P61421 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP6V0D1P61421 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP6V0D1P61421 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP6V0D1P61421 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP6V0D1P61421 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP6V0D1P61421 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP6V0D1P61421 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP6V0D1P61421 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP6V0D1P61421 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP6V0D1P61421 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP6V0D1P61421 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP6V0D1P61421 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP6V0D1P61421 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP6V0D1P61421 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP6V0D1P61421 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP6V0D1P61421 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP6V0D1P61421 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP6V0D1P61421 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP6V0D1P61421 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP6V0D1P61421 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP6V0D1P61421 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP6V0D1P61421 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP6V0D1P61421 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP6V0D1P61421 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP6V0D1P61421 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP6V0D1P61421 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP6V0D1P61421 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP6V0D1P61421 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP6V0D1P61421 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP6V0D1P61421 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP6V0D1P61421 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP6V0D1P61421 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP6V0D1P61421 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP6V0D1P61421 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP6V0D1P61421 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP6V0D1P61421 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP6V0D1P61421 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP6V0D1P61421 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP6V0D1P61421 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP6V0D1P61421 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP6V0D1P61421 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP6V0D1P61421 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP6V0D1P61421 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP6V0D1P61421 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP6V0D1P61421 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP6V0D1P61421 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP6V0D1P61421 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP6V0D1P61421 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP6V0D1P61421 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP6V0D1P61421 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP6V0D1P61421 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP6V0D1P61421 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP6V0D1P61421 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP6V0D1P61421 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP6V0D1P61421 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP6V0D1P61421 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP6V0D1P61421 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP6V0D1P61421 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP6V0D1P61421 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP6V0D1P61421 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP6V0D1P61421 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP6V0D1P61421 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP6V0D1P61421 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP6V0D1P61421 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP6V0D1P61421 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP6V0D1P61421 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP6V0D1P61421 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP6V0D1P61421 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP6V0D1P61421 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP6V0D1P61421 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP6V0D1P61421 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP6V0D1P61421 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP6V0D1P61421 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP6V0D1P61421 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP6V0D1P61421 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP6V0D1P61421 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP6V0D1P61421 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP6V0D1P61421 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP6V0D1P61421 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP6V0D1P61421 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP6V0D1P61421 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.8 ms