Protein–RNA interactions for Protein: P53794

SLC5A3, Sodium/myo-inositol cotransporter, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A3P53794 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC5A3P53794 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC5A3P53794 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC5A3P53794 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC5A3P53794 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC5A3P53794 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC5A3P53794 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC5A3P53794 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC5A3P53794 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC5A3P53794 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC5A3P53794 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC5A3P53794 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC5A3P53794 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC5A3P53794 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC5A3P53794 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC5A3P53794 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC5A3P53794 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC5A3P53794 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC5A3P53794 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC5A3P53794 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC5A3P53794 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC5A3P53794 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC5A3P53794 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC5A3P53794 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC5A3P53794 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC5A3P53794 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC5A3P53794 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC5A3P53794 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC5A3P53794 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC5A3P53794 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC5A3P53794 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC5A3P53794 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC5A3P53794 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC5A3P53794 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC5A3P53794 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC5A3P53794 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC5A3P53794 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC5A3P53794 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC5A3P53794 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC5A3P53794 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC5A3P53794 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC5A3P53794 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC5A3P53794 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC5A3P53794 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC5A3P53794 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC5A3P53794 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC5A3P53794 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC5A3P53794 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC5A3P53794 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC5A3P53794 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC5A3P53794 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC5A3P53794 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC5A3P53794 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC5A3P53794 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC5A3P53794 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC5A3P53794 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC5A3P53794 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC5A3P53794 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC5A3P53794 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC5A3P53794 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC5A3P53794 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC5A3P53794 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC5A3P53794 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC5A3P53794 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC5A3P53794 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC5A3P53794 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC5A3P53794 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC5A3P53794 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC5A3P53794 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC5A3P53794 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC5A3P53794 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC5A3P53794 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC5A3P53794 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC5A3P53794 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC5A3P53794 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC5A3P53794 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC5A3P53794 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC5A3P53794 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC5A3P53794 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC5A3P53794 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC5A3P53794 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC5A3P53794 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC5A3P53794 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC5A3P53794 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC5A3P53794 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC5A3P53794 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC5A3P53794 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC5A3P53794 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC5A3P53794 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC5A3P53794 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC5A3P53794 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC5A3P53794 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC5A3P53794 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC5A3P53794 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC5A3P53794 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC5A3P53794 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC5A3P53794 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC5A3P53794 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC5A3P53794 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLC5A3P53794 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.1 ms