Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TTPAP49638 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TTPAP49638 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TTPAP49638 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TTPAP49638 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TTPAP49638 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TTPAP49638 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TTPAP49638 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TTPAP49638 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
TTPAP49638 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TTPAP49638 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TTPAP49638 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TTPAP49638 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TTPAP49638 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TTPAP49638 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TTPAP49638 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TTPAP49638 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TTPAP49638 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TTPAP49638 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TTPAP49638 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TTPAP49638 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TTPAP49638 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TTPAP49638 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TTPAP49638 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TTPAP49638 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TTPAP49638 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TTPAP49638 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TTPAP49638 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TTPAP49638 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TTPAP49638 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TTPAP49638 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
TTPAP49638 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TTPAP49638 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TTPAP49638 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TTPAP49638 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TTPAP49638 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TTPAP49638 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TTPAP49638 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TTPAP49638 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TTPAP49638 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TTPAP49638 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
TTPAP49638 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TTPAP49638 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TTPAP49638 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
TTPAP49638 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TTPAP49638 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TTPAP49638 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TTPAP49638 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TTPAP49638 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TTPAP49638 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TTPAP49638 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TTPAP49638 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TTPAP49638 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TTPAP49638 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TTPAP49638 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TTPAP49638 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TTPAP49638 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TTPAP49638 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TTPAP49638 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TTPAP49638 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TTPAP49638 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TTPAP49638 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TTPAP49638 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TTPAP49638 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TTPAP49638 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TTPAP49638 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TTPAP49638 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TTPAP49638 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TTPAP49638 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TTPAP49638 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TTPAP49638 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TTPAP49638 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TTPAP49638 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TTPAP49638 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TTPAP49638 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TTPAP49638 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TTPAP49638 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TTPAP49638 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TTPAP49638 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TTPAP49638 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TTPAP49638 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TTPAP49638 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TTPAP49638 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TTPAP49638 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TTPAP49638 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
TTPAP49638 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TTPAP49638 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TTPAP49638 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TTPAP49638 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TTPAP49638 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TTPAP49638 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TTPAP49638 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
TTPAP49638 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TTPAP49638 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TTPAP49638 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
TTPAP49638 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TTPAP49638 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TTPAP49638 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TTPAP49638 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TTPAP49638 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
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