Protein–RNA interactions for Protein: P46060

RANGAP1, Ran GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANGAP1P46060 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RANGAP1P46060 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RANGAP1P46060 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RANGAP1P46060 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RANGAP1P46060 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RANGAP1P46060 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RANGAP1P46060 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RANGAP1P46060 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RANGAP1P46060 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RANGAP1P46060 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RANGAP1P46060 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RANGAP1P46060 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RANGAP1P46060 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RANGAP1P46060 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RANGAP1P46060 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RANGAP1P46060 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RANGAP1P46060 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RANGAP1P46060 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RANGAP1P46060 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RANGAP1P46060 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RANGAP1P46060 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RANGAP1P46060 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RANGAP1P46060 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RANGAP1P46060 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RANGAP1P46060 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RANGAP1P46060 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RANGAP1P46060 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RANGAP1P46060 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
RANGAP1P46060 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RANGAP1P46060 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RANGAP1P46060 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RANGAP1P46060 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RANGAP1P46060 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RANGAP1P46060 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RANGAP1P46060 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RANGAP1P46060 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RANGAP1P46060 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
RANGAP1P46060 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RANGAP1P46060 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RANGAP1P46060 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RANGAP1P46060 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RANGAP1P46060 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
RANGAP1P46060 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RANGAP1P46060 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RANGAP1P46060 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RANGAP1P46060 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RANGAP1P46060 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RANGAP1P46060 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RANGAP1P46060 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RANGAP1P46060 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RANGAP1P46060 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RANGAP1P46060 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RANGAP1P46060 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RANGAP1P46060 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RANGAP1P46060 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RANGAP1P46060 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RANGAP1P46060 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RANGAP1P46060 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RANGAP1P46060 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RANGAP1P46060 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RANGAP1P46060 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RANGAP1P46060 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RANGAP1P46060 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RANGAP1P46060 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
RANGAP1P46060 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RANGAP1P46060 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RANGAP1P46060 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RANGAP1P46060 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RANGAP1P46060 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RANGAP1P46060 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RANGAP1P46060 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
RANGAP1P46060 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RANGAP1P46060 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
RANGAP1P46060 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RANGAP1P46060 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RANGAP1P46060 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RANGAP1P46060 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RANGAP1P46060 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RANGAP1P46060 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RANGAP1P46060 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RANGAP1P46060 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RANGAP1P46060 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RANGAP1P46060 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RANGAP1P46060 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RANGAP1P46060 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RANGAP1P46060 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RANGAP1P46060 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RANGAP1P46060 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RANGAP1P46060 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RANGAP1P46060 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
RANGAP1P46060 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RANGAP1P46060 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RANGAP1P46060 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RANGAP1P46060 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RANGAP1P46060 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RANGAP1P46060 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RANGAP1P46060 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RANGAP1P46060 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RANGAP1P46060 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
RANGAP1P46060 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms