Protein–RNA interactions for Protein: P35052

GPC1, Glypican-1, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1P35052 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GPC1P35052 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
GPC1P35052 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GPC1P35052 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GPC1P35052 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GPC1P35052 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GPC1P35052 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GPC1P35052 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GPC1P35052 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GPC1P35052 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GPC1P35052 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GPC1P35052 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GPC1P35052 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
GPC1P35052 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GPC1P35052 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
GPC1P35052 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GPC1P35052 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
GPC1P35052 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GPC1P35052 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GPC1P35052 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GPC1P35052 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
GPC1P35052 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GPC1P35052 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GPC1P35052 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GPC1P35052 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GPC1P35052 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GPC1P35052 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GPC1P35052 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GPC1P35052 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GPC1P35052 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
GPC1P35052 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GPC1P35052 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
GPC1P35052 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
GPC1P35052 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GPC1P35052 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GPC1P35052 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GPC1P35052 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GPC1P35052 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GPC1P35052 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GPC1P35052 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GPC1P35052 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GPC1P35052 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GPC1P35052 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GPC1P35052 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GPC1P35052 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GPC1P35052 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GPC1P35052 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GPC1P35052 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GPC1P35052 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GPC1P35052 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GPC1P35052 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GPC1P35052 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GPC1P35052 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GPC1P35052 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GPC1P35052 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GPC1P35052 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GPC1P35052 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GPC1P35052 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GPC1P35052 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GPC1P35052 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GPC1P35052 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GPC1P35052 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GPC1P35052 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GPC1P35052 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GPC1P35052 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GPC1P35052 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GPC1P35052 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GPC1P35052 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GPC1P35052 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GPC1P35052 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GPC1P35052 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GPC1P35052 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GPC1P35052 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GPC1P35052 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GPC1P35052 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
GPC1P35052 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
GPC1P35052 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GPC1P35052 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GPC1P35052 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GPC1P35052 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GPC1P35052 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GPC1P35052 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GPC1P35052 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GPC1P35052 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GPC1P35052 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GPC1P35052 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GPC1P35052 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GPC1P35052 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GPC1P35052 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GPC1P35052 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GPC1P35052 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GPC1P35052 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GPC1P35052 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GPC1P35052 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GPC1P35052 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GPC1P35052 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GPC1P35052 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GPC1P35052 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GPC1P35052 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GPC1P35052 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms