Protein–RNA interactions for Protein: P26022

PTX3, Pentraxin-related protein PTX3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX3P26022 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTX3P26022 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTX3P26022 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PTX3P26022 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTX3P26022 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTX3P26022 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTX3P26022 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTX3P26022 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTX3P26022 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTX3P26022 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTX3P26022 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PTX3P26022 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTX3P26022 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PTX3P26022 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTX3P26022 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTX3P26022 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PTX3P26022 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTX3P26022 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTX3P26022 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTX3P26022 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTX3P26022 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTX3P26022 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTX3P26022 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTX3P26022 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTX3P26022 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PTX3P26022 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTX3P26022 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTX3P26022 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTX3P26022 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTX3P26022 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTX3P26022 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTX3P26022 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTX3P26022 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTX3P26022 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTX3P26022 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTX3P26022 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTX3P26022 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PTX3P26022 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTX3P26022 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTX3P26022 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTX3P26022 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTX3P26022 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTX3P26022 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTX3P26022 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTX3P26022 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PTX3P26022 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTX3P26022 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTX3P26022 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTX3P26022 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTX3P26022 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTX3P26022 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PTX3P26022 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTX3P26022 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTX3P26022 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTX3P26022 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTX3P26022 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTX3P26022 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTX3P26022 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTX3P26022 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTX3P26022 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTX3P26022 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTX3P26022 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTX3P26022 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PTX3P26022 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTX3P26022 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTX3P26022 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTX3P26022 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTX3P26022 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PTX3P26022 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTX3P26022 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTX3P26022 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTX3P26022 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTX3P26022 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTX3P26022 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTX3P26022 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTX3P26022 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTX3P26022 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTX3P26022 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTX3P26022 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTX3P26022 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTX3P26022 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTX3P26022 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTX3P26022 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTX3P26022 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTX3P26022 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTX3P26022 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTX3P26022 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTX3P26022 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTX3P26022 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTX3P26022 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTX3P26022 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTX3P26022 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTX3P26022 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTX3P26022 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PTX3P26022 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PTX3P26022 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTX3P26022 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTX3P26022 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PTX3P26022 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTX3P26022 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms