Protein–RNA interactions for Protein: P20700

LMNB1, Lamin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB1P20700 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LMNB1P20700 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LMNB1P20700 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LMNB1P20700 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LMNB1P20700 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LMNB1P20700 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LMNB1P20700 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LMNB1P20700 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LMNB1P20700 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LMNB1P20700 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LMNB1P20700 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LMNB1P20700 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LMNB1P20700 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LMNB1P20700 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LMNB1P20700 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LMNB1P20700 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LMNB1P20700 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LMNB1P20700 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LMNB1P20700 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LMNB1P20700 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LMNB1P20700 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LMNB1P20700 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LMNB1P20700 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LMNB1P20700 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LMNB1P20700 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LMNB1P20700 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LMNB1P20700 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LMNB1P20700 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LMNB1P20700 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
LMNB1P20700 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LMNB1P20700 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LMNB1P20700 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LMNB1P20700 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LMNB1P20700 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LMNB1P20700 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LMNB1P20700 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LMNB1P20700 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LMNB1P20700 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LMNB1P20700 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LMNB1P20700 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LMNB1P20700 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LMNB1P20700 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LMNB1P20700 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LMNB1P20700 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LMNB1P20700 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LMNB1P20700 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LMNB1P20700 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LMNB1P20700 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
LMNB1P20700 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LMNB1P20700 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
LMNB1P20700 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LMNB1P20700 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LMNB1P20700 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LMNB1P20700 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LMNB1P20700 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LMNB1P20700 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LMNB1P20700 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LMNB1P20700 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LMNB1P20700 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LMNB1P20700 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
LMNB1P20700 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LMNB1P20700 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LMNB1P20700 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LMNB1P20700 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LMNB1P20700 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LMNB1P20700 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LMNB1P20700 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LMNB1P20700 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LMNB1P20700 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LMNB1P20700 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LMNB1P20700 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LMNB1P20700 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LMNB1P20700 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LMNB1P20700 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LMNB1P20700 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LMNB1P20700 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LMNB1P20700 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
LMNB1P20700 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LMNB1P20700 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LMNB1P20700 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
LMNB1P20700 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LMNB1P20700 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LMNB1P20700 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LMNB1P20700 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LMNB1P20700 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LMNB1P20700 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
LMNB1P20700 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LMNB1P20700 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LMNB1P20700 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LMNB1P20700 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LMNB1P20700 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LMNB1P20700 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LMNB1P20700 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LMNB1P20700 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LMNB1P20700 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
LMNB1P20700 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LMNB1P20700 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
LMNB1P20700 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LMNB1P20700 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LMNB1P20700 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.9 ms