Protein–RNA interactions for Protein: P15976

GATA1, Erythroid transcription factor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATA1P15976 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
GATA1P15976 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
GATA1P15976 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
GATA1P15976 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
GATA1P15976 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
GATA1P15976 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
GATA1P15976 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
GATA1P15976 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
GATA1P15976 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
GATA1P15976 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
GATA1P15976 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC11.69□□□□□ -0.54
GATA1P15976 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
GATA1P15976 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
GATA1P15976 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
GATA1P15976 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
GATA1P15976 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
GATA1P15976 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
GATA1P15976 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
GATA1P15976 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
GATA1P15976 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
GATA1P15976 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
GATA1P15976 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
GATA1P15976 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
GATA1P15976 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
GATA1P15976 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
GATA1P15976 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
GATA1P15976 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
GATA1P15976 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
GATA1P15976 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
GATA1P15976 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
GATA1P15976 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
GATA1P15976 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
GATA1P15976 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
GATA1P15976 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
GATA1P15976 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
GATA1P15976 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
GATA1P15976 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
GATA1P15976 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
GATA1P15976 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
GATA1P15976 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
GATA1P15976 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
GATA1P15976 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
GATA1P15976 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
GATA1P15976 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
GATA1P15976 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
GATA1P15976 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
GATA1P15976 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
GATA1P15976 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
GATA1P15976 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
GATA1P15976 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
GATA1P15976 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
GATA1P15976 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
GATA1P15976 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
GATA1P15976 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
GATA1P15976 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
GATA1P15976 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
GATA1P15976 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
GATA1P15976 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
GATA1P15976 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
GATA1P15976 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
GATA1P15976 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
GATA1P15976 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
GATA1P15976 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
GATA1P15976 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
GATA1P15976 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
GATA1P15976 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
GATA1P15976 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
GATA1P15976 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
GATA1P15976 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
GATA1P15976 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
GATA1P15976 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
GATA1P15976 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
GATA1P15976 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
GATA1P15976 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
GATA1P15976 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC11.68□□□□□ -0.54
GATA1P15976 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
GATA1P15976 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
GATA1P15976 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
GATA1P15976 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
GATA1P15976 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
GATA1P15976 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
GATA1P15976 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
GATA1P15976 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
GATA1P15976 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC11.68□□□□□ -0.54
GATA1P15976 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
GATA1P15976 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
GATA1P15976 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
GATA1P15976 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
GATA1P15976 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
GATA1P15976 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
GATA1P15976 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
GATA1P15976 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
GATA1P15976 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
GATA1P15976 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
GATA1P15976 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
GATA1P15976 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
GATA1P15976 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
GATA1P15976 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
GATA1P15976 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
GATA1P15976 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms