Protein–RNA interactions for Protein: P14651

HOXB3, Homeobox protein Hox-B3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3P14651 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXB3P14651 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXB3P14651 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXB3P14651 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXB3P14651 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXB3P14651 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXB3P14651 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXB3P14651 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXB3P14651 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXB3P14651 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXB3P14651 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXB3P14651 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXB3P14651 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXB3P14651 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXB3P14651 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HOXB3P14651 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HOXB3P14651 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HOXB3P14651 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HOXB3P14651 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HOXB3P14651 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HOXB3P14651 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HOXB3P14651 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HOXB3P14651 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HOXB3P14651 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 AL513128.1-201ENST00000422675 469 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 C17orf58-202ENST00000449250 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 AQP8-202ENST00000566125 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 HIST2H4B-201ENST00000579512 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 AL451086.1-201ENST00000605596 223 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 AC234644.1-201ENST00000406065 370 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 MTND2P40-201ENST00000436718 841 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 EFCAB10-203ENST00000480514 740 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 AC022679.2-201ENST00000522186 813 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 AC012309.1-203ENST00000585860 965 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 AC097065.2-201ENST00000608159 533 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 PLSCR2-207ENST00000613069 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 Metazoa_SRP.128-201ENST00000620543 314 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.8 ms