Protein–RNA interactions for Protein: P02730

SLC4A1, Band 3 anion transport protein, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A1P02730 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC4A1P02730 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC4A1P02730 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC4A1P02730 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC4A1P02730 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC4A1P02730 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC4A1P02730 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC4A1P02730 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC4A1P02730 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC4A1P02730 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC4A1P02730 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC4A1P02730 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC4A1P02730 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC4A1P02730 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC4A1P02730 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC4A1P02730 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC4A1P02730 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC4A1P02730 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC4A1P02730 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC4A1P02730 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC4A1P02730 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC4A1P02730 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC4A1P02730 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC4A1P02730 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC4A1P02730 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC4A1P02730 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC4A1P02730 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC4A1P02730 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC4A1P02730 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC4A1P02730 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC4A1P02730 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC4A1P02730 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC4A1P02730 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC4A1P02730 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC4A1P02730 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC4A1P02730 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC4A1P02730 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC4A1P02730 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC4A1P02730 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC4A1P02730 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC4A1P02730 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC4A1P02730 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC4A1P02730 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC4A1P02730 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC4A1P02730 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC4A1P02730 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC4A1P02730 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC4A1P02730 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC4A1P02730 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC4A1P02730 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC4A1P02730 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC4A1P02730 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC4A1P02730 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC4A1P02730 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC4A1P02730 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC4A1P02730 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC4A1P02730 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC4A1P02730 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC4A1P02730 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC4A1P02730 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC4A1P02730 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC4A1P02730 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC4A1P02730 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC4A1P02730 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC4A1P02730 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC4A1P02730 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC4A1P02730 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC4A1P02730 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC4A1P02730 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC4A1P02730 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC4A1P02730 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC4A1P02730 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC4A1P02730 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC4A1P02730 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC4A1P02730 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC4A1P02730 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC4A1P02730 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC4A1P02730 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC4A1P02730 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC4A1P02730 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC4A1P02730 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC4A1P02730 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC4A1P02730 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC4A1P02730 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC4A1P02730 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC4A1P02730 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC4A1P02730 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC4A1P02730 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC4A1P02730 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC4A1P02730 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC4A1P02730 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC4A1P02730 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC4A1P02730 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC4A1P02730 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC4A1P02730 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC4A1P02730 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC4A1P02730 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC4A1P02730 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC4A1P02730 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC4A1P02730 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms