Protein–RNA interactions for Protein: O95484

CLDN9, Claudin-9, humanhuman

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Length 217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN9O95484 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN9O95484 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN9O95484 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN9O95484 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN9O95484 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN9O95484 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN9O95484 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN9O95484 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN9O95484 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN9O95484 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN9O95484 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN9O95484 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN9O95484 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN9O95484 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN9O95484 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN9O95484 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN9O95484 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN9O95484 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN9O95484 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN9O95484 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN9O95484 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN9O95484 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN9O95484 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN9O95484 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN9O95484 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN9O95484 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN9O95484 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN9O95484 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN9O95484 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN9O95484 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN9O95484 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN9O95484 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN9O95484 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN9O95484 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN9O95484 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN9O95484 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN9O95484 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN9O95484 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN9O95484 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN9O95484 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN9O95484 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN9O95484 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN9O95484 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN9O95484 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN9O95484 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN9O95484 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN9O95484 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN9O95484 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN9O95484 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN9O95484 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN9O95484 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN9O95484 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN9O95484 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN9O95484 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN9O95484 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN9O95484 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN9O95484 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN9O95484 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN9O95484 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN9O95484 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN9O95484 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN9O95484 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN9O95484 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN9O95484 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN9O95484 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN9O95484 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN9O95484 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN9O95484 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN9O95484 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN9O95484 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN9O95484 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN9O95484 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN9O95484 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN9O95484 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN9O95484 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN9O95484 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN9O95484 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN9O95484 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN9O95484 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN9O95484 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN9O95484 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN9O95484 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN9O95484 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN9O95484 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN9O95484 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLDN9O95484 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLDN9O95484 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLDN9O95484 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLDN9O95484 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLDN9O95484 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLDN9O95484 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLDN9O95484 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLDN9O95484 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLDN9O95484 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLDN9O95484 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLDN9O95484 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLDN9O95484 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLDN9O95484 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLDN9O95484 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLDN9O95484 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
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