Protein–RNA interactions for Protein: O95352

ATG7, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme ATG7, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG7O95352 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATG7O95352 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATG7O95352 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATG7O95352 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATG7O95352 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATG7O95352 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATG7O95352 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATG7O95352 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ATG7O95352 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATG7O95352 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATG7O95352 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATG7O95352 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATG7O95352 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ATG7O95352 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ATG7O95352 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATG7O95352 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATG7O95352 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ATG7O95352 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ATG7O95352 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ATG7O95352 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATG7O95352 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATG7O95352 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ATG7O95352 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATG7O95352 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATG7O95352 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ATG7O95352 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATG7O95352 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATG7O95352 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATG7O95352 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATG7O95352 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATG7O95352 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATG7O95352 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATG7O95352 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATG7O95352 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATG7O95352 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATG7O95352 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATG7O95352 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATG7O95352 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATG7O95352 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATG7O95352 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATG7O95352 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATG7O95352 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATG7O95352 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATG7O95352 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATG7O95352 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATG7O95352 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATG7O95352 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATG7O95352 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATG7O95352 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATG7O95352 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATG7O95352 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATG7O95352 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATG7O95352 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATG7O95352 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATG7O95352 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATG7O95352 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATG7O95352 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATG7O95352 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATG7O95352 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATG7O95352 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATG7O95352 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATG7O95352 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATG7O95352 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATG7O95352 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATG7O95352 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATG7O95352 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATG7O95352 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATG7O95352 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ATG7O95352 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATG7O95352 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATG7O95352 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATG7O95352 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATG7O95352 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATG7O95352 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATG7O95352 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ATG7O95352 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ATG7O95352 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ATG7O95352 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATG7O95352 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATG7O95352 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATG7O95352 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATG7O95352 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATG7O95352 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATG7O95352 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATG7O95352 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATG7O95352 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATG7O95352 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATG7O95352 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATG7O95352 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATG7O95352 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATG7O95352 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATG7O95352 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATG7O95352 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATG7O95352 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATG7O95352 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATG7O95352 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATG7O95352 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATG7O95352 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATG7O95352 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATG7O95352 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms