Protein–RNA interactions for Protein: O43736

ITM2A, Integral membrane protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITM2AO43736 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ITM2AO43736 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ITM2AO43736 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ITM2AO43736 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ITM2AO43736 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ITM2AO43736 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ITM2AO43736 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ITM2AO43736 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ITM2AO43736 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ITM2AO43736 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ITM2AO43736 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ITM2AO43736 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITM2AO43736 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITM2AO43736 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITM2AO43736 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITM2AO43736 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITM2AO43736 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITM2AO43736 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITM2AO43736 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITM2AO43736 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITM2AO43736 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITM2AO43736 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITM2AO43736 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITM2AO43736 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITM2AO43736 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITM2AO43736 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITM2AO43736 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITM2AO43736 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITM2AO43736 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITM2AO43736 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITM2AO43736 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ITM2AO43736 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITM2AO43736 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITM2AO43736 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ITM2AO43736 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITM2AO43736 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITM2AO43736 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITM2AO43736 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITM2AO43736 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITM2AO43736 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITM2AO43736 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITM2AO43736 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITM2AO43736 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ITM2AO43736 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITM2AO43736 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITM2AO43736 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ITM2AO43736 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITM2AO43736 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITM2AO43736 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITM2AO43736 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITM2AO43736 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITM2AO43736 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITM2AO43736 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITM2AO43736 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITM2AO43736 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITM2AO43736 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITM2AO43736 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITM2AO43736 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITM2AO43736 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITM2AO43736 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITM2AO43736 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITM2AO43736 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITM2AO43736 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITM2AO43736 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITM2AO43736 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITM2AO43736 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITM2AO43736 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITM2AO43736 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITM2AO43736 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITM2AO43736 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITM2AO43736 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITM2AO43736 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITM2AO43736 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITM2AO43736 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITM2AO43736 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITM2AO43736 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITM2AO43736 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITM2AO43736 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITM2AO43736 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITM2AO43736 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITM2AO43736 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ITM2AO43736 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITM2AO43736 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITM2AO43736 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITM2AO43736 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITM2AO43736 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITM2AO43736 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITM2AO43736 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITM2AO43736 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITM2AO43736 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITM2AO43736 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITM2AO43736 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITM2AO43736 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITM2AO43736 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITM2AO43736 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITM2AO43736 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITM2AO43736 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITM2AO43736 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITM2AO43736 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITM2AO43736 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms