Protein–RNA interactions for Protein: O15205

UBD, Ubiquitin D, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBDO15205 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBDO15205 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBDO15205 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBDO15205 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBDO15205 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBDO15205 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBDO15205 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBDO15205 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBDO15205 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBDO15205 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBDO15205 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBDO15205 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBDO15205 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBDO15205 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBDO15205 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBDO15205 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBDO15205 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBDO15205 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBDO15205 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
UBDO15205 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
UBDO15205 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
UBDO15205 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
UBDO15205 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
UBDO15205 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
UBDO15205 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
UBDO15205 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
UBDO15205 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
UBDO15205 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
UBDO15205 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
UBDO15205 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
UBDO15205 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBDO15205 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBDO15205 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBDO15205 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBDO15205 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBDO15205 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBDO15205 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBDO15205 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBDO15205 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBDO15205 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBDO15205 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBDO15205 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBDO15205 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBDO15205 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
UBDO15205 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBDO15205 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
UBDO15205 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
UBDO15205 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBDO15205 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBDO15205 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBDO15205 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
UBDO15205 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBDO15205 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBDO15205 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBDO15205 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBDO15205 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBDO15205 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBDO15205 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBDO15205 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBDO15205 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBDO15205 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBDO15205 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBDO15205 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBDO15205 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBDO15205 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBDO15205 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
UBDO15205 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBDO15205 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
UBDO15205 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
UBDO15205 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
UBDO15205 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBDO15205 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBDO15205 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBDO15205 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBDO15205 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBDO15205 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBDO15205 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBDO15205 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBDO15205 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBDO15205 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBDO15205 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBDO15205 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBDO15205 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBDO15205 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBDO15205 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBDO15205 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBDO15205 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBDO15205 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
UBDO15205 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
UBDO15205 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
UBDO15205 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBDO15205 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBDO15205 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBDO15205 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBDO15205 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBDO15205 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBDO15205 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
UBDO15205 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBDO15205 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBDO15205 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.4 ms