Protein–RNA interactions for Protein: A6NGN4

PRAMEF25, PRAME family member 25, humanhuman

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF25A6NGN4 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
PRAMEF25A6NGN4 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
PRAMEF25A6NGN4 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PRAMEF25A6NGN4 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PRAMEF25A6NGN4 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PRAMEF25A6NGN4 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PRAMEF25A6NGN4 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PRAMEF25A6NGN4 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PRAMEF25A6NGN4 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PRAMEF25A6NGN4 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PRAMEF25A6NGN4 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PRAMEF25A6NGN4 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PRAMEF25A6NGN4 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PRAMEF25A6NGN4 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PRAMEF25A6NGN4 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PRAMEF25A6NGN4 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PRAMEF25A6NGN4 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
PRAMEF25A6NGN4 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
PRAMEF25A6NGN4 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PRAMEF25A6NGN4 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PRAMEF25A6NGN4 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PRAMEF25A6NGN4 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PRAMEF25A6NGN4 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
PRAMEF25A6NGN4 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
PRAMEF25A6NGN4 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PRAMEF25A6NGN4 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PRAMEF25A6NGN4 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PRAMEF25A6NGN4 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PRAMEF25A6NGN4 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PRAMEF25A6NGN4 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PRAMEF25A6NGN4 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PRAMEF25A6NGN4 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PRAMEF25A6NGN4 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PRAMEF25A6NGN4 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PRAMEF25A6NGN4 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PRAMEF25A6NGN4 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PRAMEF25A6NGN4 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PRAMEF25A6NGN4 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PRAMEF25A6NGN4 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PRAMEF25A6NGN4 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PRAMEF25A6NGN4 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PRAMEF25A6NGN4 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PRAMEF25A6NGN4 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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PRAMEF25A6NGN4 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
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PRAMEF25A6NGN4 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PRAMEF25A6NGN4 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PRAMEF25A6NGN4 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PRAMEF25A6NGN4 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PRAMEF25A6NGN4 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PRAMEF25A6NGN4 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PRAMEF25A6NGN4 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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PRAMEF25A6NGN4 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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PRAMEF25A6NGN4 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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PRAMEF25A6NGN4 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PRAMEF25A6NGN4 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PRAMEF25A6NGN4 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
PRAMEF25A6NGN4 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PRAMEF25A6NGN4 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PRAMEF25A6NGN4 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PRAMEF25A6NGN4 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PRAMEF25A6NGN4 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PRAMEF25A6NGN4 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PRAMEF25A6NGN4 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
PRAMEF25A6NGN4 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
PRAMEF25A6NGN4 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PRAMEF25A6NGN4 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PRAMEF25A6NGN4 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PRAMEF25A6NGN4 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PRAMEF25A6NGN4 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PRAMEF25A6NGN4 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PRAMEF25A6NGN4 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PRAMEF25A6NGN4 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PRAMEF25A6NGN4 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PRAMEF25A6NGN4 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PRAMEF25A6NGN4 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PRAMEF25A6NGN4 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PRAMEF25A6NGN4 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PRAMEF25A6NGN4 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PRAMEF25A6NGN4 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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