Protein–RNA interactions for Protein: A2IDD5

CCDC78, Coiled-coil domain-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78A2IDD5 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms