Protein–RNA interactions for Protein: A2A3N6

PIPSL, Putative PIP5K1A and PSMD4-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIPSLA2A3N6 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.1 ms