Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4P1

ATG4B, Cysteine protease ATG4B, humanhuman

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Length 393 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4BQ9Y4P1 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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ATG4BQ9Y4P1 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
ATG4BQ9Y4P1 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ATG4BQ9Y4P1 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ATG4BQ9Y4P1 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ATG4BQ9Y4P1 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ATG4BQ9Y4P1 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ATG4BQ9Y4P1 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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ATG4BQ9Y4P1 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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ATG4BQ9Y4P1 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ATG4BQ9Y4P1 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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ATG4BQ9Y4P1 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ATG4BQ9Y4P1 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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ATG4BQ9Y4P1 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
ATG4BQ9Y4P1 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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ATG4BQ9Y4P1 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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ATG4BQ9Y4P1 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
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ATG4BQ9Y4P1 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
ATG4BQ9Y4P1 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
ATG4BQ9Y4P1 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
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ATG4BQ9Y4P1 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
ATG4BQ9Y4P1 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
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ATG4BQ9Y4P1 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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ATG4BQ9Y4P1 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATG4BQ9Y4P1 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATG4BQ9Y4P1 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATG4BQ9Y4P1 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATG4BQ9Y4P1 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATG4BQ9Y4P1 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATG4BQ9Y4P1 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATG4BQ9Y4P1 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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