Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX0

IGSF9B, Protein turtle homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9BQ9UPX0 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IGSF9BQ9UPX0 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IGSF9BQ9UPX0 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IGSF9BQ9UPX0 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IGSF9BQ9UPX0 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IGSF9BQ9UPX0 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
IGSF9BQ9UPX0 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IGSF9BQ9UPX0 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IGSF9BQ9UPX0 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IGSF9BQ9UPX0 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IGSF9BQ9UPX0 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IGSF9BQ9UPX0 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IGSF9BQ9UPX0 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
IGSF9BQ9UPX0 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IGSF9BQ9UPX0 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IGSF9BQ9UPX0 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
IGSF9BQ9UPX0 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IGSF9BQ9UPX0 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IGSF9BQ9UPX0 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IGSF9BQ9UPX0 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IGSF9BQ9UPX0 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IGSF9BQ9UPX0 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IGSF9BQ9UPX0 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IGSF9BQ9UPX0 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IGSF9BQ9UPX0 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IGSF9BQ9UPX0 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IGSF9BQ9UPX0 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IGSF9BQ9UPX0 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IGSF9BQ9UPX0 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IGSF9BQ9UPX0 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IGSF9BQ9UPX0 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
IGSF9BQ9UPX0 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
IGSF9BQ9UPX0 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
IGSF9BQ9UPX0 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.41
IGSF9BQ9UPX0 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
IGSF9BQ9UPX0 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
IGSF9BQ9UPX0 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
IGSF9BQ9UPX0 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
IGSF9BQ9UPX0 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
IGSF9BQ9UPX0 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
IGSF9BQ9UPX0 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
IGSF9BQ9UPX0 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
IGSF9BQ9UPX0 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
IGSF9BQ9UPX0 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
IGSF9BQ9UPX0 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
IGSF9BQ9UPX0 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
IGSF9BQ9UPX0 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
IGSF9BQ9UPX0 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
IGSF9BQ9UPX0 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
IGSF9BQ9UPX0 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
IGSF9BQ9UPX0 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
IGSF9BQ9UPX0 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
IGSF9BQ9UPX0 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
IGSF9BQ9UPX0 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
IGSF9BQ9UPX0 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
IGSF9BQ9UPX0 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
IGSF9BQ9UPX0 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
IGSF9BQ9UPX0 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
IGSF9BQ9UPX0 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
IGSF9BQ9UPX0 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
IGSF9BQ9UPX0 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
IGSF9BQ9UPX0 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
IGSF9BQ9UPX0 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
IGSF9BQ9UPX0 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
IGSF9BQ9UPX0 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
IGSF9BQ9UPX0 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
IGSF9BQ9UPX0 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
IGSF9BQ9UPX0 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
IGSF9BQ9UPX0 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
IGSF9BQ9UPX0 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
IGSF9BQ9UPX0 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
IGSF9BQ9UPX0 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
IGSF9BQ9UPX0 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
IGSF9BQ9UPX0 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
IGSF9BQ9UPX0 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
IGSF9BQ9UPX0 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
IGSF9BQ9UPX0 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
IGSF9BQ9UPX0 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
IGSF9BQ9UPX0 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
IGSF9BQ9UPX0 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
IGSF9BQ9UPX0 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
IGSF9BQ9UPX0 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
IGSF9BQ9UPX0 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
IGSF9BQ9UPX0 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
IGSF9BQ9UPX0 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
IGSF9BQ9UPX0 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
IGSF9BQ9UPX0 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
IGSF9BQ9UPX0 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
IGSF9BQ9UPX0 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
IGSF9BQ9UPX0 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
IGSF9BQ9UPX0 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
IGSF9BQ9UPX0 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
IGSF9BQ9UPX0 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
IGSF9BQ9UPX0 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
IGSF9BQ9UPX0 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
IGSF9BQ9UPX0 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
IGSF9BQ9UPX0 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
IGSF9BQ9UPX0 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
IGSF9BQ9UPX0 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
IGSF9BQ9UPX0 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms