Protein–RNA interactions for Protein: Q9UP95

SLC12A4, Solute carrier family 12 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,085 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A4Q9UP95 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC12A4Q9UP95 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC12A4Q9UP95 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC12A4Q9UP95 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC12A4Q9UP95 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC12A4Q9UP95 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC12A4Q9UP95 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC12A4Q9UP95 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC12A4Q9UP95 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC12A4Q9UP95 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC12A4Q9UP95 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC12A4Q9UP95 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC12A4Q9UP95 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC12A4Q9UP95 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC12A4Q9UP95 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC12A4Q9UP95 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC12A4Q9UP95 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC12A4Q9UP95 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC12A4Q9UP95 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC12A4Q9UP95 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC12A4Q9UP95 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC12A4Q9UP95 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC12A4Q9UP95 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC12A4Q9UP95 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC12A4Q9UP95 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC12A4Q9UP95 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC12A4Q9UP95 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC12A4Q9UP95 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC12A4Q9UP95 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC12A4Q9UP95 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC12A4Q9UP95 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC12A4Q9UP95 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC12A4Q9UP95 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC12A4Q9UP95 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC12A4Q9UP95 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC12A4Q9UP95 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC12A4Q9UP95 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC12A4Q9UP95 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC12A4Q9UP95 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC12A4Q9UP95 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC12A4Q9UP95 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC12A4Q9UP95 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC12A4Q9UP95 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC12A4Q9UP95 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC12A4Q9UP95 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC12A4Q9UP95 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC12A4Q9UP95 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC12A4Q9UP95 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC12A4Q9UP95 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC12A4Q9UP95 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC12A4Q9UP95 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC12A4Q9UP95 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC12A4Q9UP95 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC12A4Q9UP95 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC12A4Q9UP95 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC12A4Q9UP95 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC12A4Q9UP95 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC12A4Q9UP95 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC12A4Q9UP95 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC12A4Q9UP95 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC12A4Q9UP95 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC12A4Q9UP95 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC12A4Q9UP95 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC12A4Q9UP95 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC12A4Q9UP95 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC12A4Q9UP95 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC12A4Q9UP95 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC12A4Q9UP95 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC12A4Q9UP95 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC12A4Q9UP95 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC12A4Q9UP95 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC12A4Q9UP95 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC12A4Q9UP95 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC12A4Q9UP95 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC12A4Q9UP95 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC12A4Q9UP95 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC12A4Q9UP95 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC12A4Q9UP95 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC12A4Q9UP95 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC12A4Q9UP95 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC12A4Q9UP95 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC12A4Q9UP95 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC12A4Q9UP95 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC12A4Q9UP95 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC12A4Q9UP95 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC12A4Q9UP95 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC12A4Q9UP95 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC12A4Q9UP95 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC12A4Q9UP95 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC12A4Q9UP95 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC12A4Q9UP95 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC12A4Q9UP95 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC12A4Q9UP95 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC12A4Q9UP95 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC12A4Q9UP95 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC12A4Q9UP95 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC12A4Q9UP95 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC12A4Q9UP95 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC12A4Q9UP95 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC12A4Q9UP95 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms