Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT6

ZNRF3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF3Q9ULT6 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNRF3Q9ULT6 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNRF3Q9ULT6 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNRF3Q9ULT6 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNRF3Q9ULT6 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNRF3Q9ULT6 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNRF3Q9ULT6 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNRF3Q9ULT6 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNRF3Q9ULT6 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNRF3Q9ULT6 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNRF3Q9ULT6 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNRF3Q9ULT6 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNRF3Q9ULT6 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNRF3Q9ULT6 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNRF3Q9ULT6 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNRF3Q9ULT6 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNRF3Q9ULT6 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNRF3Q9ULT6 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNRF3Q9ULT6 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNRF3Q9ULT6 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNRF3Q9ULT6 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNRF3Q9ULT6 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNRF3Q9ULT6 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNRF3Q9ULT6 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNRF3Q9ULT6 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNRF3Q9ULT6 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNRF3Q9ULT6 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNRF3Q9ULT6 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNRF3Q9ULT6 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNRF3Q9ULT6 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNRF3Q9ULT6 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNRF3Q9ULT6 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNRF3Q9ULT6 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNRF3Q9ULT6 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNRF3Q9ULT6 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNRF3Q9ULT6 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNRF3Q9ULT6 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNRF3Q9ULT6 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNRF3Q9ULT6 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNRF3Q9ULT6 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNRF3Q9ULT6 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNRF3Q9ULT6 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNRF3Q9ULT6 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNRF3Q9ULT6 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNRF3Q9ULT6 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNRF3Q9ULT6 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNRF3Q9ULT6 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNRF3Q9ULT6 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNRF3Q9ULT6 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNRF3Q9ULT6 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNRF3Q9ULT6 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNRF3Q9ULT6 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNRF3Q9ULT6 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNRF3Q9ULT6 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNRF3Q9ULT6 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNRF3Q9ULT6 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNRF3Q9ULT6 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNRF3Q9ULT6 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNRF3Q9ULT6 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNRF3Q9ULT6 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNRF3Q9ULT6 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNRF3Q9ULT6 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNRF3Q9ULT6 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNRF3Q9ULT6 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNRF3Q9ULT6 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNRF3Q9ULT6 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNRF3Q9ULT6 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNRF3Q9ULT6 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNRF3Q9ULT6 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNRF3Q9ULT6 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNRF3Q9ULT6 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNRF3Q9ULT6 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNRF3Q9ULT6 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNRF3Q9ULT6 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNRF3Q9ULT6 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNRF3Q9ULT6 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNRF3Q9ULT6 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNRF3Q9ULT6 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNRF3Q9ULT6 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNRF3Q9ULT6 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNRF3Q9ULT6 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNRF3Q9ULT6 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNRF3Q9ULT6 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNRF3Q9ULT6 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNRF3Q9ULT6 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNRF3Q9ULT6 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNRF3Q9ULT6 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNRF3Q9ULT6 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNRF3Q9ULT6 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNRF3Q9ULT6 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNRF3Q9ULT6 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNRF3Q9ULT6 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNRF3Q9ULT6 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNRF3Q9ULT6 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNRF3Q9ULT6 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNRF3Q9ULT6 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNRF3Q9ULT6 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNRF3Q9ULT6 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNRF3Q9ULT6 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNRF3Q9ULT6 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms