Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E9

RRBP1, Ribosome-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRBP1Q9P2E9 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RRBP1Q9P2E9 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RRBP1Q9P2E9 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RRBP1Q9P2E9 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RRBP1Q9P2E9 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RRBP1Q9P2E9 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RRBP1Q9P2E9 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RRBP1Q9P2E9 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RRBP1Q9P2E9 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RRBP1Q9P2E9 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RRBP1Q9P2E9 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RRBP1Q9P2E9 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RRBP1Q9P2E9 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RRBP1Q9P2E9 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RRBP1Q9P2E9 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RRBP1Q9P2E9 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RRBP1Q9P2E9 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RRBP1Q9P2E9 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RRBP1Q9P2E9 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RRBP1Q9P2E9 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
RRBP1Q9P2E9 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RRBP1Q9P2E9 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RRBP1Q9P2E9 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RRBP1Q9P2E9 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RRBP1Q9P2E9 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RRBP1Q9P2E9 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RRBP1Q9P2E9 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RRBP1Q9P2E9 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RRBP1Q9P2E9 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RRBP1Q9P2E9 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RRBP1Q9P2E9 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RRBP1Q9P2E9 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RRBP1Q9P2E9 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RRBP1Q9P2E9 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RRBP1Q9P2E9 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RRBP1Q9P2E9 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RRBP1Q9P2E9 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
RRBP1Q9P2E9 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RRBP1Q9P2E9 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
RRBP1Q9P2E9 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RRBP1Q9P2E9 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RRBP1Q9P2E9 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
RRBP1Q9P2E9 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RRBP1Q9P2E9 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RRBP1Q9P2E9 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
RRBP1Q9P2E9 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RRBP1Q9P2E9 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RRBP1Q9P2E9 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RRBP1Q9P2E9 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RRBP1Q9P2E9 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RRBP1Q9P2E9 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RRBP1Q9P2E9 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RRBP1Q9P2E9 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RRBP1Q9P2E9 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RRBP1Q9P2E9 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RRBP1Q9P2E9 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RRBP1Q9P2E9 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RRBP1Q9P2E9 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RRBP1Q9P2E9 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
RRBP1Q9P2E9 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RRBP1Q9P2E9 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RRBP1Q9P2E9 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RRBP1Q9P2E9 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RRBP1Q9P2E9 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RRBP1Q9P2E9 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RRBP1Q9P2E9 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RRBP1Q9P2E9 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RRBP1Q9P2E9 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RRBP1Q9P2E9 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RRBP1Q9P2E9 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RRBP1Q9P2E9 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RRBP1Q9P2E9 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
RRBP1Q9P2E9 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RRBP1Q9P2E9 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RRBP1Q9P2E9 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RRBP1Q9P2E9 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
RRBP1Q9P2E9 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RRBP1Q9P2E9 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
RRBP1Q9P2E9 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RRBP1Q9P2E9 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RRBP1Q9P2E9 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RRBP1Q9P2E9 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RRBP1Q9P2E9 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RRBP1Q9P2E9 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RRBP1Q9P2E9 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RRBP1Q9P2E9 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RRBP1Q9P2E9 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RRBP1Q9P2E9 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RRBP1Q9P2E9 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RRBP1Q9P2E9 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RRBP1Q9P2E9 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RRBP1Q9P2E9 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RRBP1Q9P2E9 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RRBP1Q9P2E9 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RRBP1Q9P2E9 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RRBP1Q9P2E9 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RRBP1Q9P2E9 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
RRBP1Q9P2E9 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RRBP1Q9P2E9 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RRBP1Q9P2E9 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms