Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z2

CALCOCO1, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO1Q9P1Z2 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CALCOCO1Q9P1Z2 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CALCOCO1Q9P1Z2 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CALCOCO1Q9P1Z2 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CALCOCO1Q9P1Z2 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CALCOCO1Q9P1Z2 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CALCOCO1Q9P1Z2 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CALCOCO1Q9P1Z2 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CALCOCO1Q9P1Z2 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CALCOCO1Q9P1Z2 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CALCOCO1Q9P1Z2 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CALCOCO1Q9P1Z2 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CALCOCO1Q9P1Z2 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CALCOCO1Q9P1Z2 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CALCOCO1Q9P1Z2 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CALCOCO1Q9P1Z2 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CALCOCO1Q9P1Z2 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CALCOCO1Q9P1Z2 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CALCOCO1Q9P1Z2 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CALCOCO1Q9P1Z2 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CALCOCO1Q9P1Z2 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CALCOCO1Q9P1Z2 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CALCOCO1Q9P1Z2 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CALCOCO1Q9P1Z2 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CALCOCO1Q9P1Z2 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CALCOCO1Q9P1Z2 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CALCOCO1Q9P1Z2 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CALCOCO1Q9P1Z2 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CALCOCO1Q9P1Z2 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CALCOCO1Q9P1Z2 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CALCOCO1Q9P1Z2 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CALCOCO1Q9P1Z2 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CALCOCO1Q9P1Z2 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CALCOCO1Q9P1Z2 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CALCOCO1Q9P1Z2 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CALCOCO1Q9P1Z2 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CALCOCO1Q9P1Z2 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CALCOCO1Q9P1Z2 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CALCOCO1Q9P1Z2 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CALCOCO1Q9P1Z2 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CALCOCO1Q9P1Z2 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CALCOCO1Q9P1Z2 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CALCOCO1Q9P1Z2 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CALCOCO1Q9P1Z2 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CALCOCO1Q9P1Z2 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CALCOCO1Q9P1Z2 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CALCOCO1Q9P1Z2 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CALCOCO1Q9P1Z2 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CALCOCO1Q9P1Z2 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CALCOCO1Q9P1Z2 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CALCOCO1Q9P1Z2 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CALCOCO1Q9P1Z2 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CALCOCO1Q9P1Z2 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CALCOCO1Q9P1Z2 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CALCOCO1Q9P1Z2 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CALCOCO1Q9P1Z2 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CALCOCO1Q9P1Z2 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CALCOCO1Q9P1Z2 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CALCOCO1Q9P1Z2 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CALCOCO1Q9P1Z2 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CALCOCO1Q9P1Z2 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CALCOCO1Q9P1Z2 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CALCOCO1Q9P1Z2 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CALCOCO1Q9P1Z2 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CALCOCO1Q9P1Z2 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CALCOCO1Q9P1Z2 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CALCOCO1Q9P1Z2 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CALCOCO1Q9P1Z2 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CALCOCO1Q9P1Z2 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CALCOCO1Q9P1Z2 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CALCOCO1Q9P1Z2 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CALCOCO1Q9P1Z2 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CALCOCO1Q9P1Z2 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CALCOCO1Q9P1Z2 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CALCOCO1Q9P1Z2 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CALCOCO1Q9P1Z2 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CALCOCO1Q9P1Z2 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CALCOCO1Q9P1Z2 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CALCOCO1Q9P1Z2 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CALCOCO1Q9P1Z2 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CALCOCO1Q9P1Z2 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CALCOCO1Q9P1Z2 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CALCOCO1Q9P1Z2 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CALCOCO1Q9P1Z2 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CALCOCO1Q9P1Z2 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CALCOCO1Q9P1Z2 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CALCOCO1Q9P1Z2 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CALCOCO1Q9P1Z2 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CALCOCO1Q9P1Z2 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CALCOCO1Q9P1Z2 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CALCOCO1Q9P1Z2 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CALCOCO1Q9P1Z2 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CALCOCO1Q9P1Z2 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CALCOCO1Q9P1Z2 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CALCOCO1Q9P1Z2 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CALCOCO1Q9P1Z2 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CALCOCO1Q9P1Z2 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CALCOCO1Q9P1Z2 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CALCOCO1Q9P1Z2 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
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