Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F0

ASXL3, Putative Polycomb group protein ASXL3, humanhuman

Predictions only

Length 2,248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASXL3Q9C0F0 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ASXL3Q9C0F0 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ASXL3Q9C0F0 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ASXL3Q9C0F0 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ASXL3Q9C0F0 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ASXL3Q9C0F0 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ASXL3Q9C0F0 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ASXL3Q9C0F0 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ASXL3Q9C0F0 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ASXL3Q9C0F0 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ASXL3Q9C0F0 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ASXL3Q9C0F0 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ASXL3Q9C0F0 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ASXL3Q9C0F0 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ASXL3Q9C0F0 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ASXL3Q9C0F0 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ASXL3Q9C0F0 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ASXL3Q9C0F0 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ASXL3Q9C0F0 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ASXL3Q9C0F0 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ASXL3Q9C0F0 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ASXL3Q9C0F0 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ASXL3Q9C0F0 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ASXL3Q9C0F0 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ASXL3Q9C0F0 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ASXL3Q9C0F0 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ASXL3Q9C0F0 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ASXL3Q9C0F0 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ASXL3Q9C0F0 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ASXL3Q9C0F0 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ASXL3Q9C0F0 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ASXL3Q9C0F0 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ASXL3Q9C0F0 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ASXL3Q9C0F0 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ASXL3Q9C0F0 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ASXL3Q9C0F0 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ASXL3Q9C0F0 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ASXL3Q9C0F0 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ASXL3Q9C0F0 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ASXL3Q9C0F0 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ASXL3Q9C0F0 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ASXL3Q9C0F0 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ASXL3Q9C0F0 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ASXL3Q9C0F0 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ASXL3Q9C0F0 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ASXL3Q9C0F0 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ASXL3Q9C0F0 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ASXL3Q9C0F0 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ASXL3Q9C0F0 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ASXL3Q9C0F0 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ASXL3Q9C0F0 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ASXL3Q9C0F0 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ASXL3Q9C0F0 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ASXL3Q9C0F0 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ASXL3Q9C0F0 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ASXL3Q9C0F0 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ASXL3Q9C0F0 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ASXL3Q9C0F0 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ASXL3Q9C0F0 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ASXL3Q9C0F0 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ASXL3Q9C0F0 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ASXL3Q9C0F0 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ASXL3Q9C0F0 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ASXL3Q9C0F0 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ASXL3Q9C0F0 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ASXL3Q9C0F0 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ASXL3Q9C0F0 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ASXL3Q9C0F0 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ASXL3Q9C0F0 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ASXL3Q9C0F0 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ASXL3Q9C0F0 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ASXL3Q9C0F0 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ASXL3Q9C0F0 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ASXL3Q9C0F0 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ASXL3Q9C0F0 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ASXL3Q9C0F0 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ASXL3Q9C0F0 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ASXL3Q9C0F0 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ASXL3Q9C0F0 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ASXL3Q9C0F0 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ASXL3Q9C0F0 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ASXL3Q9C0F0 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ASXL3Q9C0F0 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ASXL3Q9C0F0 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ASXL3Q9C0F0 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ASXL3Q9C0F0 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ASXL3Q9C0F0 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ASXL3Q9C0F0 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ASXL3Q9C0F0 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ASXL3Q9C0F0 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ASXL3Q9C0F0 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ASXL3Q9C0F0 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ASXL3Q9C0F0 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ASXL3Q9C0F0 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ASXL3Q9C0F0 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ASXL3Q9C0F0 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ASXL3Q9C0F0 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ASXL3Q9C0F0 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ASXL3Q9C0F0 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ASXL3Q9C0F0 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.8 ms