Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYR7

KRTAP3-2, Keratin-associated protein 3-2, humanhuman

Predictions only

Length 98 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP3-2Q9BYR7 C11orf70-205ENST00000534360 520 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP3-2Q9BYR7 AL132777.1-201ENST00000556153 618 ntBASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP3-2Q9BYR7 AC020661.3-201ENST00000558101 414 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP3-2Q9BYR7 AC005154.1-230ENST00000578994 644 ntTSL 4 BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP3-2Q9BYR7 AC022211.1-201ENST00000579554 717 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP3-2Q9BYR7 RN7SL237P-201ENST00000580912 287 ntBASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP3-2Q9BYR7 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP3-2Q9BYR7 AC015911.2-201ENST00000585536 396 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP3-2Q9BYR7 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP3-2Q9BYR7 AC007786.1-202ENST00000590607 443 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP3-2Q9BYR7 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP3-2Q9BYR7 AL078624.1-201ENST00000604004 547 ntBASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP3-2Q9BYR7 AL662844.3-201ENST00000606909 517 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP3-2Q9BYR7 AL020991.1-201ENST00000612314 373 ntBASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP3-2Q9BYR7 AL034428.1-202ENST00000613736 625 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP3-2Q9BYR7 AC092683.2-203ENST00000618807 788 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP3-2Q9BYR7 AC137590.2-201ENST00000619709 240 ntBASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP3-2Q9BYR7 LINC00643-207ENST00000637212 734 ntBASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP3-2Q9BYR7 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP3-2Q9BYR7 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP3-2Q9BYR7 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP3-2Q9BYR7 UGT2B28-202ENST00000511240 1525 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP3-2Q9BYR7 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP3-2Q9BYR7 OR4K16P-202ENST00000641135 1506 ntBASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP3-2Q9BYR7 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP3-2Q9BYR7 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP3-2Q9BYR7 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP3-2Q9BYR7 MBNL3-201ENST00000370839 1575 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP3-2Q9BYR7 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP3-2Q9BYR7 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP3-2Q9BYR7 ZNF213-AS1-203ENST00000571963 1592 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP3-2Q9BYR7 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP3-2Q9BYR7 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP3-2Q9BYR7 MOGAT3-201ENST00000223114 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP3-2Q9BYR7 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP3-2Q9BYR7 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP3-2Q9BYR7 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP3-2Q9BYR7 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP3-2Q9BYR7 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP3-2Q9BYR7 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP3-2Q9BYR7 ZNF610-208ENST00000613461 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP3-2Q9BYR7 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP3-2Q9BYR7 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP3-2Q9BYR7 AC131888.1-201ENST00000625028 2168 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP3-2Q9BYR7 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP3-2Q9BYR7 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP3-2Q9BYR7 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP3-2Q9BYR7 ORC6-204ENST00000566860 1699 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP3-2Q9BYR7 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP3-2Q9BYR7 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP3-2Q9BYR7 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP3-2Q9BYR7 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP3-2Q9BYR7 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP3-2Q9BYR7 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP3-2Q9BYR7 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP3-2Q9BYR7 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP3-2Q9BYR7 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP3-2Q9BYR7 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP3-2Q9BYR7 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP3-2Q9BYR7 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP3-2Q9BYR7 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP3-2Q9BYR7 TTN-AS1-204ENST00000431259 1472 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP3-2Q9BYR7 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP3-2Q9BYR7 ZNF565-201ENST00000304116 2023 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP3-2Q9BYR7 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP3-2Q9BYR7 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP3-2Q9BYR7 MTHFD2P1-203ENST00000494840 2595 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP3-2Q9BYR7 HLA-DQA2-210ENST00000374940 1524 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP3-2Q9BYR7 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP3-2Q9BYR7 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP3-2Q9BYR7 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP3-2Q9BYR7 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP3-2Q9BYR7 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP3-2Q9BYR7 TRPM3-205ENST00000361823 1260 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP3-2Q9BYR7 OR6K6-201ENST00000368144 1172 ntAPPRIS P2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP3-2Q9BYR7 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP3-2Q9BYR7 HMGN1-202ENST00000380747 709 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP3-2Q9BYR7 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP3-2Q9BYR7 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP3-2Q9BYR7 FCF1P10-201ENST00000407590 479 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP3-2Q9BYR7 AL358452.1-201ENST00000414995 800 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP3-2Q9BYR7 OR4A8-201ENST00000418689 945 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP3-2Q9BYR7 AL513185.2-201ENST00000425543 193 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP3-2Q9BYR7 MTND4LP10-201ENST00000435146 291 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP3-2Q9BYR7 AC016908.1-201ENST00000442571 1219 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP3-2Q9BYR7 CDCA4P3-201ENST00000442572 689 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP3-2Q9BYR7 RPL7P36-201ENST00000444633 681 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP3-2Q9BYR7 EIF4A1P6-201ENST00000448133 1210 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP3-2Q9BYR7 TMSB4X-204ENST00000451311 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP3-2Q9BYR7 KATNBL1P6-201ENST00000453433 915 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP3-2Q9BYR7 RAD23BP3-201ENST00000454157 1152 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP3-2Q9BYR7 AC025566.1-201ENST00000477153 490 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP3-2Q9BYR7 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP3-2Q9BYR7 XAGE1B-205ENST00000518075 472 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP3-2Q9BYR7 AP001207.1-201ENST00000524051 481 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP3-2Q9BYR7 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP3-2Q9BYR7 AP000781.2-202ENST00000529411 681 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP3-2Q9BYR7 AC044839.1-209ENST00000529769 878 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP3-2Q9BYR7 AC068205.2-201ENST00000532864 771 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP3-2Q9BYR7 ORMDL2-203ENST00000548974 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.3 ms