Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG3

NIFK, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIFKQ9BYG3 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NIFKQ9BYG3 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NIFKQ9BYG3 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NIFKQ9BYG3 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NIFKQ9BYG3 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NIFKQ9BYG3 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NIFKQ9BYG3 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
NIFKQ9BYG3 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NIFKQ9BYG3 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NIFKQ9BYG3 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NIFKQ9BYG3 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NIFKQ9BYG3 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NIFKQ9BYG3 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NIFKQ9BYG3 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NIFKQ9BYG3 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NIFKQ9BYG3 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NIFKQ9BYG3 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NIFKQ9BYG3 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
NIFKQ9BYG3 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NIFKQ9BYG3 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NIFKQ9BYG3 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NIFKQ9BYG3 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NIFKQ9BYG3 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NIFKQ9BYG3 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NIFKQ9BYG3 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NIFKQ9BYG3 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NIFKQ9BYG3 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NIFKQ9BYG3 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NIFKQ9BYG3 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NIFKQ9BYG3 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NIFKQ9BYG3 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NIFKQ9BYG3 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NIFKQ9BYG3 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NIFKQ9BYG3 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NIFKQ9BYG3 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NIFKQ9BYG3 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NIFKQ9BYG3 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NIFKQ9BYG3 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
NIFKQ9BYG3 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NIFKQ9BYG3 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NIFKQ9BYG3 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NIFKQ9BYG3 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NIFKQ9BYG3 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NIFKQ9BYG3 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
NIFKQ9BYG3 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
NIFKQ9BYG3 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NIFKQ9BYG3 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
NIFKQ9BYG3 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NIFKQ9BYG3 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NIFKQ9BYG3 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
NIFKQ9BYG3 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NIFKQ9BYG3 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NIFKQ9BYG3 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NIFKQ9BYG3 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NIFKQ9BYG3 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NIFKQ9BYG3 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NIFKQ9BYG3 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NIFKQ9BYG3 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NIFKQ9BYG3 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NIFKQ9BYG3 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NIFKQ9BYG3 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NIFKQ9BYG3 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NIFKQ9BYG3 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NIFKQ9BYG3 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NIFKQ9BYG3 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NIFKQ9BYG3 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NIFKQ9BYG3 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NIFKQ9BYG3 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NIFKQ9BYG3 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NIFKQ9BYG3 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NIFKQ9BYG3 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NIFKQ9BYG3 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NIFKQ9BYG3 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NIFKQ9BYG3 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NIFKQ9BYG3 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NIFKQ9BYG3 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NIFKQ9BYG3 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NIFKQ9BYG3 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NIFKQ9BYG3 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NIFKQ9BYG3 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NIFKQ9BYG3 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NIFKQ9BYG3 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NIFKQ9BYG3 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NIFKQ9BYG3 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NIFKQ9BYG3 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
NIFKQ9BYG3 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
NIFKQ9BYG3 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NIFKQ9BYG3 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
NIFKQ9BYG3 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NIFKQ9BYG3 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NIFKQ9BYG3 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NIFKQ9BYG3 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NIFKQ9BYG3 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NIFKQ9BYG3 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NIFKQ9BYG3 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
NIFKQ9BYG3 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NIFKQ9BYG3 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NIFKQ9BYG3 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
NIFKQ9BYG3 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NIFKQ9BYG3 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms