Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY12

SCAPER, S phase cyclin A-associated protein in the endoplasmic reticulum, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPERQ9BY12 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCAPERQ9BY12 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCAPERQ9BY12 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCAPERQ9BY12 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCAPERQ9BY12 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCAPERQ9BY12 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCAPERQ9BY12 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCAPERQ9BY12 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCAPERQ9BY12 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCAPERQ9BY12 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCAPERQ9BY12 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCAPERQ9BY12 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCAPERQ9BY12 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SCAPERQ9BY12 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCAPERQ9BY12 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCAPERQ9BY12 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCAPERQ9BY12 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCAPERQ9BY12 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCAPERQ9BY12 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCAPERQ9BY12 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCAPERQ9BY12 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCAPERQ9BY12 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCAPERQ9BY12 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCAPERQ9BY12 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCAPERQ9BY12 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCAPERQ9BY12 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCAPERQ9BY12 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SCAPERQ9BY12 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCAPERQ9BY12 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCAPERQ9BY12 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCAPERQ9BY12 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCAPERQ9BY12 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCAPERQ9BY12 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCAPERQ9BY12 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCAPERQ9BY12 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCAPERQ9BY12 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCAPERQ9BY12 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SCAPERQ9BY12 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SCAPERQ9BY12 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCAPERQ9BY12 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCAPERQ9BY12 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCAPERQ9BY12 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SCAPERQ9BY12 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCAPERQ9BY12 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCAPERQ9BY12 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCAPERQ9BY12 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCAPERQ9BY12 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SCAPERQ9BY12 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCAPERQ9BY12 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCAPERQ9BY12 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCAPERQ9BY12 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCAPERQ9BY12 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCAPERQ9BY12 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCAPERQ9BY12 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCAPERQ9BY12 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCAPERQ9BY12 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCAPERQ9BY12 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCAPERQ9BY12 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCAPERQ9BY12 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCAPERQ9BY12 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCAPERQ9BY12 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCAPERQ9BY12 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCAPERQ9BY12 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCAPERQ9BY12 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCAPERQ9BY12 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SCAPERQ9BY12 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCAPERQ9BY12 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCAPERQ9BY12 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCAPERQ9BY12 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCAPERQ9BY12 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCAPERQ9BY12 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCAPERQ9BY12 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCAPERQ9BY12 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCAPERQ9BY12 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCAPERQ9BY12 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCAPERQ9BY12 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCAPERQ9BY12 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCAPERQ9BY12 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCAPERQ9BY12 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SCAPERQ9BY12 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCAPERQ9BY12 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCAPERQ9BY12 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCAPERQ9BY12 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCAPERQ9BY12 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCAPERQ9BY12 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SCAPERQ9BY12 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCAPERQ9BY12 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCAPERQ9BY12 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCAPERQ9BY12 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCAPERQ9BY12 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCAPERQ9BY12 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCAPERQ9BY12 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCAPERQ9BY12 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCAPERQ9BY12 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCAPERQ9BY12 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SCAPERQ9BY12 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCAPERQ9BY12 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCAPERQ9BY12 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCAPERQ9BY12 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCAPERQ9BY12 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms