Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NUP58Q9BVL2 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NUP58Q9BVL2 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NUP58Q9BVL2 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NUP58Q9BVL2 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NUP58Q9BVL2 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NUP58Q9BVL2 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NUP58Q9BVL2 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NUP58Q9BVL2 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NUP58Q9BVL2 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NUP58Q9BVL2 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NUP58Q9BVL2 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NUP58Q9BVL2 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NUP58Q9BVL2 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NUP58Q9BVL2 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NUP58Q9BVL2 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NUP58Q9BVL2 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NUP58Q9BVL2 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NUP58Q9BVL2 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NUP58Q9BVL2 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NUP58Q9BVL2 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NUP58Q9BVL2 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NUP58Q9BVL2 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NUP58Q9BVL2 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NUP58Q9BVL2 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NUP58Q9BVL2 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NUP58Q9BVL2 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
NUP58Q9BVL2 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NUP58Q9BVL2 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NUP58Q9BVL2 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NUP58Q9BVL2 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NUP58Q9BVL2 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NUP58Q9BVL2 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NUP58Q9BVL2 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NUP58Q9BVL2 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NUP58Q9BVL2 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NUP58Q9BVL2 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NUP58Q9BVL2 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NUP58Q9BVL2 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NUP58Q9BVL2 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NUP58Q9BVL2 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NUP58Q9BVL2 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NUP58Q9BVL2 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NUP58Q9BVL2 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NUP58Q9BVL2 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NUP58Q9BVL2 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NUP58Q9BVL2 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NUP58Q9BVL2 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NUP58Q9BVL2 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NUP58Q9BVL2 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NUP58Q9BVL2 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
NUP58Q9BVL2 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NUP58Q9BVL2 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NUP58Q9BVL2 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NUP58Q9BVL2 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NUP58Q9BVL2 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NUP58Q9BVL2 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NUP58Q9BVL2 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
NUP58Q9BVL2 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NUP58Q9BVL2 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NUP58Q9BVL2 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NUP58Q9BVL2 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NUP58Q9BVL2 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NUP58Q9BVL2 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
NUP58Q9BVL2 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NUP58Q9BVL2 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NUP58Q9BVL2 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NUP58Q9BVL2 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NUP58Q9BVL2 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NUP58Q9BVL2 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NUP58Q9BVL2 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NUP58Q9BVL2 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NUP58Q9BVL2 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NUP58Q9BVL2 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NUP58Q9BVL2 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NUP58Q9BVL2 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NUP58Q9BVL2 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NUP58Q9BVL2 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NUP58Q9BVL2 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NUP58Q9BVL2 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NUP58Q9BVL2 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NUP58Q9BVL2 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NUP58Q9BVL2 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NUP58Q9BVL2 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NUP58Q9BVL2 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NUP58Q9BVL2 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NUP58Q9BVL2 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NUP58Q9BVL2 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NUP58Q9BVL2 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NUP58Q9BVL2 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NUP58Q9BVL2 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NUP58Q9BVL2 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NUP58Q9BVL2 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NUP58Q9BVL2 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NUP58Q9BVL2 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NUP58Q9BVL2 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NUP58Q9BVL2 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NUP58Q9BVL2 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NUP58Q9BVL2 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NUP58Q9BVL2 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms