Protein–RNA interactions for Protein: Q99743

NPAS2, Neuronal PAS domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS2Q99743 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NPAS2Q99743 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NPAS2Q99743 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NPAS2Q99743 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NPAS2Q99743 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NPAS2Q99743 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NPAS2Q99743 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NPAS2Q99743 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NPAS2Q99743 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NPAS2Q99743 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NPAS2Q99743 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NPAS2Q99743 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NPAS2Q99743 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NPAS2Q99743 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NPAS2Q99743 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NPAS2Q99743 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NPAS2Q99743 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NPAS2Q99743 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NPAS2Q99743 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NPAS2Q99743 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NPAS2Q99743 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NPAS2Q99743 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NPAS2Q99743 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NPAS2Q99743 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NPAS2Q99743 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NPAS2Q99743 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NPAS2Q99743 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NPAS2Q99743 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NPAS2Q99743 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NPAS2Q99743 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NPAS2Q99743 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NPAS2Q99743 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NPAS2Q99743 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NPAS2Q99743 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NPAS2Q99743 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NPAS2Q99743 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NPAS2Q99743 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NPAS2Q99743 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NPAS2Q99743 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NPAS2Q99743 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NPAS2Q99743 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NPAS2Q99743 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NPAS2Q99743 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NPAS2Q99743 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NPAS2Q99743 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NPAS2Q99743 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NPAS2Q99743 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NPAS2Q99743 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NPAS2Q99743 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NPAS2Q99743 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NPAS2Q99743 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPAS2Q99743 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPAS2Q99743 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPAS2Q99743 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPAS2Q99743 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPAS2Q99743 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPAS2Q99743 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPAS2Q99743 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPAS2Q99743 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPAS2Q99743 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPAS2Q99743 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPAS2Q99743 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPAS2Q99743 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPAS2Q99743 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPAS2Q99743 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPAS2Q99743 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPAS2Q99743 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPAS2Q99743 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPAS2Q99743 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NPAS2Q99743 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPAS2Q99743 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPAS2Q99743 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPAS2Q99743 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPAS2Q99743 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPAS2Q99743 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPAS2Q99743 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPAS2Q99743 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPAS2Q99743 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPAS2Q99743 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPAS2Q99743 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPAS2Q99743 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPAS2Q99743 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPAS2Q99743 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPAS2Q99743 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPAS2Q99743 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPAS2Q99743 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPAS2Q99743 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPAS2Q99743 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPAS2Q99743 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPAS2Q99743 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPAS2Q99743 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPAS2Q99743 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPAS2Q99743 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPAS2Q99743 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPAS2Q99743 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NPAS2Q99743 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NPAS2Q99743 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPAS2Q99743 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPAS2Q99743 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPAS2Q99743 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.9 ms